Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH2

Cd300ld, CMRF35-like molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ldQ8VCH2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd300ldQ8VCH2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd300ldQ8VCH2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd300ldQ8VCH2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd300ldQ8VCH2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd300ldQ8VCH2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd300ldQ8VCH2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd300ldQ8VCH2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd300ldQ8VCH2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd300ldQ8VCH2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd300ldQ8VCH2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd300ldQ8VCH2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd300ldQ8VCH2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd300ldQ8VCH2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd300ldQ8VCH2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd300ldQ8VCH2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd300ldQ8VCH2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd300ldQ8VCH2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd300ldQ8VCH2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd300ldQ8VCH2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cd300ldQ8VCH2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cd300ldQ8VCH2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cd300ldQ8VCH2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cd300ldQ8VCH2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cd300ldQ8VCH2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cd300ldQ8VCH2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cd300ldQ8VCH2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cd300ldQ8VCH2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cd300ldQ8VCH2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cd300ldQ8VCH2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cd300ldQ8VCH2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cd300ldQ8VCH2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd300ldQ8VCH2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd300ldQ8VCH2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cd300ldQ8VCH2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cd300ldQ8VCH2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cd300ldQ8VCH2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cd300ldQ8VCH2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cd300ldQ8VCH2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cd300ldQ8VCH2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cd300ldQ8VCH2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cd300ldQ8VCH2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cd300ldQ8VCH2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cd300ldQ8VCH2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cd300ldQ8VCH2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cd300ldQ8VCH2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cd300ldQ8VCH2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cd300ldQ8VCH2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cd300ldQ8VCH2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cd300ldQ8VCH2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cd300ldQ8VCH2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cd300ldQ8VCH2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cd300ldQ8VCH2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cd300ldQ8VCH2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cd300ldQ8VCH2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cd300ldQ8VCH2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cd300ldQ8VCH2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cd300ldQ8VCH2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cd300ldQ8VCH2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cd300ldQ8VCH2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd300ldQ8VCH2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd300ldQ8VCH2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd300ldQ8VCH2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd300ldQ8VCH2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd300ldQ8VCH2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd300ldQ8VCH2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd300ldQ8VCH2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd300ldQ8VCH2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd300ldQ8VCH2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd300ldQ8VCH2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd300ldQ8VCH2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd300ldQ8VCH2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd300ldQ8VCH2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd300ldQ8VCH2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd300ldQ8VCH2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd300ldQ8VCH2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd300ldQ8VCH2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd300ldQ8VCH2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd300ldQ8VCH2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cd300ldQ8VCH2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cd300ldQ8VCH2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cd300ldQ8VCH2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd300ldQ8VCH2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd300ldQ8VCH2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd300ldQ8VCH2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd300ldQ8VCH2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd300ldQ8VCH2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd300ldQ8VCH2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd300ldQ8VCH2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd300ldQ8VCH2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd300ldQ8VCH2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd300ldQ8VCH2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd300ldQ8VCH2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd300ldQ8VCH2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd300ldQ8VCH2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd300ldQ8VCH2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd300ldQ8VCH2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd300ldQ8VCH2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd300ldQ8VCH2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd300ldQ8VCH2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms