Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW8

Ttc36, Tetratricopeptide repeat protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc36Q8VBW8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc36Q8VBW8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc36Q8VBW8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc36Q8VBW8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc36Q8VBW8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc36Q8VBW8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc36Q8VBW8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc36Q8VBW8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc36Q8VBW8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc36Q8VBW8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc36Q8VBW8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc36Q8VBW8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc36Q8VBW8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc36Q8VBW8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc36Q8VBW8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc36Q8VBW8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc36Q8VBW8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc36Q8VBW8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc36Q8VBW8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc36Q8VBW8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc36Q8VBW8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc36Q8VBW8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc36Q8VBW8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc36Q8VBW8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc36Q8VBW8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc36Q8VBW8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc36Q8VBW8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc36Q8VBW8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttc36Q8VBW8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc36Q8VBW8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc36Q8VBW8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc36Q8VBW8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc36Q8VBW8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc36Q8VBW8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc36Q8VBW8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc36Q8VBW8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc36Q8VBW8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc36Q8VBW8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc36Q8VBW8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc36Q8VBW8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc36Q8VBW8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc36Q8VBW8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc36Q8VBW8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc36Q8VBW8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc36Q8VBW8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc36Q8VBW8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc36Q8VBW8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc36Q8VBW8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc36Q8VBW8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc36Q8VBW8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc36Q8VBW8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc36Q8VBW8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc36Q8VBW8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc36Q8VBW8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc36Q8VBW8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc36Q8VBW8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc36Q8VBW8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc36Q8VBW8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc36Q8VBW8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc36Q8VBW8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttc36Q8VBW8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc36Q8VBW8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc36Q8VBW8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc36Q8VBW8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc36Q8VBW8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc36Q8VBW8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc36Q8VBW8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc36Q8VBW8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc36Q8VBW8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc36Q8VBW8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc36Q8VBW8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc36Q8VBW8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc36Q8VBW8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc36Q8VBW8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc36Q8VBW8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc36Q8VBW8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc36Q8VBW8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc36Q8VBW8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc36Q8VBW8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc36Q8VBW8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc36Q8VBW8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc36Q8VBW8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc36Q8VBW8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc36Q8VBW8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc36Q8VBW8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc36Q8VBW8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc36Q8VBW8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc36Q8VBW8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc36Q8VBW8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc36Q8VBW8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc36Q8VBW8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc36Q8VBW8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc36Q8VBW8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc36Q8VBW8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc36Q8VBW8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc36Q8VBW8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc36Q8VBW8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc36Q8VBW8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc36Q8VBW8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc36Q8VBW8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms