Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BbxQ8VBW5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BbxQ8VBW5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BbxQ8VBW5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BbxQ8VBW5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BbxQ8VBW5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BbxQ8VBW5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
BbxQ8VBW5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BbxQ8VBW5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BbxQ8VBW5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BbxQ8VBW5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BbxQ8VBW5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BbxQ8VBW5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BbxQ8VBW5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BbxQ8VBW5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BbxQ8VBW5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BbxQ8VBW5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BbxQ8VBW5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BbxQ8VBW5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BbxQ8VBW5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BbxQ8VBW5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BbxQ8VBW5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BbxQ8VBW5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BbxQ8VBW5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BbxQ8VBW5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BbxQ8VBW5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BbxQ8VBW5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BbxQ8VBW5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BbxQ8VBW5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BbxQ8VBW5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BbxQ8VBW5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BbxQ8VBW5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BbxQ8VBW5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BbxQ8VBW5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BbxQ8VBW5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BbxQ8VBW5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BbxQ8VBW5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BbxQ8VBW5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BbxQ8VBW5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BbxQ8VBW5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BbxQ8VBW5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BbxQ8VBW5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BbxQ8VBW5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BbxQ8VBW5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BbxQ8VBW5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BbxQ8VBW5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BbxQ8VBW5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BbxQ8VBW5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BbxQ8VBW5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BbxQ8VBW5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BbxQ8VBW5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BbxQ8VBW5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BbxQ8VBW5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BbxQ8VBW5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BbxQ8VBW5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BbxQ8VBW5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BbxQ8VBW5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BbxQ8VBW5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BbxQ8VBW5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BbxQ8VBW5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BbxQ8VBW5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BbxQ8VBW5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BbxQ8VBW5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BbxQ8VBW5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BbxQ8VBW5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BbxQ8VBW5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BbxQ8VBW5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BbxQ8VBW5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BbxQ8VBW5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BbxQ8VBW5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BbxQ8VBW5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BbxQ8VBW5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BbxQ8VBW5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BbxQ8VBW5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BbxQ8VBW5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26■■□□□ 1.75
BbxQ8VBW5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BbxQ8VBW5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BbxQ8VBW5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BbxQ8VBW5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BbxQ8VBW5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BbxQ8VBW5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BbxQ8VBW5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BbxQ8VBW5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BbxQ8VBW5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BbxQ8VBW5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BbxQ8VBW5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BbxQ8VBW5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BbxQ8VBW5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BbxQ8VBW5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BbxQ8VBW5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BbxQ8VBW5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BbxQ8VBW5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BbxQ8VBW5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BbxQ8VBW5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BbxQ8VBW5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BbxQ8VBW5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BbxQ8VBW5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BbxQ8VBW5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BbxQ8VBW5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BbxQ8VBW5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms