Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4F0

Mcoln3, Mucolipin-3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln3Q8R4F0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcoln3Q8R4F0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcoln3Q8R4F0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcoln3Q8R4F0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mcoln3Q8R4F0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mcoln3Q8R4F0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mcoln3Q8R4F0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mcoln3Q8R4F0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mcoln3Q8R4F0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mcoln3Q8R4F0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mcoln3Q8R4F0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mcoln3Q8R4F0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mcoln3Q8R4F0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mcoln3Q8R4F0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mcoln3Q8R4F0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mcoln3Q8R4F0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mcoln3Q8R4F0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mcoln3Q8R4F0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcoln3Q8R4F0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcoln3Q8R4F0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcoln3Q8R4F0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mcoln3Q8R4F0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mcoln3Q8R4F0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mcoln3Q8R4F0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Mcoln3Q8R4F0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mcoln3Q8R4F0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mcoln3Q8R4F0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mcoln3Q8R4F0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcoln3Q8R4F0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcoln3Q8R4F0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcoln3Q8R4F0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcoln3Q8R4F0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcoln3Q8R4F0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcoln3Q8R4F0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mcoln3Q8R4F0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcoln3Q8R4F0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcoln3Q8R4F0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcoln3Q8R4F0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcoln3Q8R4F0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcoln3Q8R4F0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcoln3Q8R4F0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcoln3Q8R4F0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcoln3Q8R4F0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcoln3Q8R4F0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcoln3Q8R4F0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcoln3Q8R4F0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcoln3Q8R4F0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcoln3Q8R4F0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcoln3Q8R4F0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcoln3Q8R4F0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcoln3Q8R4F0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcoln3Q8R4F0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcoln3Q8R4F0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcoln3Q8R4F0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcoln3Q8R4F0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcoln3Q8R4F0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcoln3Q8R4F0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcoln3Q8R4F0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcoln3Q8R4F0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcoln3Q8R4F0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcoln3Q8R4F0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcoln3Q8R4F0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcoln3Q8R4F0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcoln3Q8R4F0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcoln3Q8R4F0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcoln3Q8R4F0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcoln3Q8R4F0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mcoln3Q8R4F0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mcoln3Q8R4F0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mcoln3Q8R4F0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mcoln3Q8R4F0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcoln3Q8R4F0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcoln3Q8R4F0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcoln3Q8R4F0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mcoln3Q8R4F0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mcoln3Q8R4F0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mcoln3Q8R4F0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mcoln3Q8R4F0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mcoln3Q8R4F0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mcoln3Q8R4F0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Mcoln3Q8R4F0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mcoln3Q8R4F0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mcoln3Q8R4F0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mcoln3Q8R4F0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Mcoln3Q8R4F0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mcoln3Q8R4F0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mcoln3Q8R4F0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcoln3Q8R4F0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcoln3Q8R4F0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcoln3Q8R4F0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcoln3Q8R4F0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcoln3Q8R4F0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcoln3Q8R4F0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcoln3Q8R4F0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcoln3Q8R4F0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcoln3Q8R4F0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcoln3Q8R4F0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcoln3Q8R4F0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcoln3Q8R4F0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcoln3Q8R4F0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms