Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2K4

Taf6l, TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6lQ8R2K4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Taf6lQ8R2K4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Taf6lQ8R2K4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Taf6lQ8R2K4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Taf6lQ8R2K4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Taf6lQ8R2K4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Taf6lQ8R2K4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Taf6lQ8R2K4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Taf6lQ8R2K4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf6lQ8R2K4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf6lQ8R2K4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf6lQ8R2K4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf6lQ8R2K4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf6lQ8R2K4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf6lQ8R2K4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Taf6lQ8R2K4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Taf6lQ8R2K4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Taf6lQ8R2K4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Taf6lQ8R2K4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Taf6lQ8R2K4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Taf6lQ8R2K4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Taf6lQ8R2K4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Taf6lQ8R2K4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Taf6lQ8R2K4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Taf6lQ8R2K4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Taf6lQ8R2K4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Taf6lQ8R2K4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Taf6lQ8R2K4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Taf6lQ8R2K4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Taf6lQ8R2K4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Taf6lQ8R2K4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Taf6lQ8R2K4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Taf6lQ8R2K4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Taf6lQ8R2K4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Taf6lQ8R2K4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Taf6lQ8R2K4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Taf6lQ8R2K4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Taf6lQ8R2K4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Taf6lQ8R2K4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Taf6lQ8R2K4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Taf6lQ8R2K4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Taf6lQ8R2K4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Taf6lQ8R2K4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Taf6lQ8R2K4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Taf6lQ8R2K4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Taf6lQ8R2K4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Taf6lQ8R2K4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Taf6lQ8R2K4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Taf6lQ8R2K4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Taf6lQ8R2K4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Taf6lQ8R2K4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Taf6lQ8R2K4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Taf6lQ8R2K4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Taf6lQ8R2K4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Taf6lQ8R2K4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Taf6lQ8R2K4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Taf6lQ8R2K4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Taf6lQ8R2K4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Taf6lQ8R2K4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Taf6lQ8R2K4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Taf6lQ8R2K4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Taf6lQ8R2K4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Taf6lQ8R2K4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Taf6lQ8R2K4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Taf6lQ8R2K4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Taf6lQ8R2K4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Taf6lQ8R2K4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Taf6lQ8R2K4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Taf6lQ8R2K4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Taf6lQ8R2K4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Taf6lQ8R2K4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Taf6lQ8R2K4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Taf6lQ8R2K4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Taf6lQ8R2K4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Taf6lQ8R2K4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Taf6lQ8R2K4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Taf6lQ8R2K4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Taf6lQ8R2K4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Taf6lQ8R2K4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Taf6lQ8R2K4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Taf6lQ8R2K4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Taf6lQ8R2K4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Taf6lQ8R2K4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Taf6lQ8R2K4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Taf6lQ8R2K4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Taf6lQ8R2K4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Taf6lQ8R2K4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Taf6lQ8R2K4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Taf6lQ8R2K4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Taf6lQ8R2K4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Taf6lQ8R2K4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Taf6lQ8R2K4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Taf6lQ8R2K4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Taf6lQ8R2K4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Taf6lQ8R2K4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Taf6lQ8R2K4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Taf6lQ8R2K4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Taf6lQ8R2K4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Taf6lQ8R2K4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Taf6lQ8R2K4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms