Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1U1

Cog4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog4Q8R1U1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cog4Q8R1U1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cog4Q8R1U1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cog4Q8R1U1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cog4Q8R1U1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cog4Q8R1U1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cog4Q8R1U1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cog4Q8R1U1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cog4Q8R1U1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cog4Q8R1U1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cog4Q8R1U1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cog4Q8R1U1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cog4Q8R1U1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cog4Q8R1U1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cog4Q8R1U1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cog4Q8R1U1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cog4Q8R1U1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cog4Q8R1U1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cog4Q8R1U1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cog4Q8R1U1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cog4Q8R1U1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cog4Q8R1U1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cog4Q8R1U1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cog4Q8R1U1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cog4Q8R1U1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cog4Q8R1U1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cog4Q8R1U1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cog4Q8R1U1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cog4Q8R1U1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cog4Q8R1U1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cog4Q8R1U1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cog4Q8R1U1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cog4Q8R1U1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cog4Q8R1U1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cog4Q8R1U1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cog4Q8R1U1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cog4Q8R1U1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cog4Q8R1U1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cog4Q8R1U1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cog4Q8R1U1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cog4Q8R1U1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cog4Q8R1U1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cog4Q8R1U1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cog4Q8R1U1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cog4Q8R1U1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cog4Q8R1U1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cog4Q8R1U1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cog4Q8R1U1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cog4Q8R1U1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cog4Q8R1U1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cog4Q8R1U1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cog4Q8R1U1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cog4Q8R1U1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cog4Q8R1U1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cog4Q8R1U1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cog4Q8R1U1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cog4Q8R1U1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cog4Q8R1U1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cog4Q8R1U1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cog4Q8R1U1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cog4Q8R1U1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cog4Q8R1U1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cog4Q8R1U1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cog4Q8R1U1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cog4Q8R1U1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms