Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc5Q8K4Z2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc5Q8K4Z2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc5Q8K4Z2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc5Q8K4Z2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc5Q8K4Z2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc5Q8K4Z2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc5Q8K4Z2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc5Q8K4Z2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc5Q8K4Z2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc5Q8K4Z2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc5Q8K4Z2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc5Q8K4Z2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc5Q8K4Z2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc5Q8K4Z2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc5Q8K4Z2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc5Q8K4Z2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc5Q8K4Z2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc5Q8K4Z2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc5Q8K4Z2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc5Q8K4Z2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc5Q8K4Z2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc5Q8K4Z2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fndc5Q8K4Z2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc5Q8K4Z2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc5Q8K4Z2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc5Q8K4Z2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc5Q8K4Z2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc5Q8K4Z2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc5Q8K4Z2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc5Q8K4Z2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc5Q8K4Z2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc5Q8K4Z2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc5Q8K4Z2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc5Q8K4Z2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc5Q8K4Z2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc5Q8K4Z2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc5Q8K4Z2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc5Q8K4Z2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc5Q8K4Z2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc5Q8K4Z2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc5Q8K4Z2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc5Q8K4Z2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc5Q8K4Z2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc5Q8K4Z2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc5Q8K4Z2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc5Q8K4Z2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc5Q8K4Z2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc5Q8K4Z2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc5Q8K4Z2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc5Q8K4Z2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc5Q8K4Z2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc5Q8K4Z2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc5Q8K4Z2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc5Q8K4Z2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc5Q8K4Z2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc5Q8K4Z2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc5Q8K4Z2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc5Q8K4Z2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc5Q8K4Z2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc5Q8K4Z2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc5Q8K4Z2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc5Q8K4Z2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc5Q8K4Z2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc5Q8K4Z2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc5Q8K4Z2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc5Q8K4Z2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc5Q8K4Z2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc5Q8K4Z2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc5Q8K4Z2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc5Q8K4Z2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc5Q8K4Z2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc5Q8K4Z2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc5Q8K4Z2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc5Q8K4Z2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms