Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J0

Dclre1c, Protein artemis, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1cQ8K4J0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dclre1cQ8K4J0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dclre1cQ8K4J0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dclre1cQ8K4J0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dclre1cQ8K4J0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dclre1cQ8K4J0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dclre1cQ8K4J0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dclre1cQ8K4J0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Dclre1cQ8K4J0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dclre1cQ8K4J0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dclre1cQ8K4J0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dclre1cQ8K4J0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dclre1cQ8K4J0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dclre1cQ8K4J0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dclre1cQ8K4J0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dclre1cQ8K4J0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dclre1cQ8K4J0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dclre1cQ8K4J0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dclre1cQ8K4J0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dclre1cQ8K4J0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dclre1cQ8K4J0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dclre1cQ8K4J0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dclre1cQ8K4J0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclre1cQ8K4J0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclre1cQ8K4J0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclre1cQ8K4J0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dclre1cQ8K4J0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dclre1cQ8K4J0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclre1cQ8K4J0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclre1cQ8K4J0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclre1cQ8K4J0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclre1cQ8K4J0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclre1cQ8K4J0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclre1cQ8K4J0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dclre1cQ8K4J0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dclre1cQ8K4J0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dclre1cQ8K4J0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dclre1cQ8K4J0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dclre1cQ8K4J0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dclre1cQ8K4J0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dclre1cQ8K4J0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dclre1cQ8K4J0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclre1cQ8K4J0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclre1cQ8K4J0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dclre1cQ8K4J0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dclre1cQ8K4J0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dclre1cQ8K4J0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dclre1cQ8K4J0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dclre1cQ8K4J0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dclre1cQ8K4J0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dclre1cQ8K4J0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dclre1cQ8K4J0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dclre1cQ8K4J0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dclre1cQ8K4J0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dclre1cQ8K4J0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dclre1cQ8K4J0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dclre1cQ8K4J0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dclre1cQ8K4J0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dclre1cQ8K4J0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclre1cQ8K4J0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclre1cQ8K4J0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclre1cQ8K4J0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclre1cQ8K4J0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclre1cQ8K4J0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclre1cQ8K4J0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclre1cQ8K4J0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dclre1cQ8K4J0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dclre1cQ8K4J0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dclre1cQ8K4J0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dclre1cQ8K4J0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dclre1cQ8K4J0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dclre1cQ8K4J0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dclre1cQ8K4J0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dclre1cQ8K4J0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dclre1cQ8K4J0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dclre1cQ8K4J0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dclre1cQ8K4J0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dclre1cQ8K4J0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.1 ms