Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrtm1Q8K377 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrtm1Q8K377 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrtm1Q8K377 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrtm1Q8K377 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrtm1Q8K377 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrtm1Q8K377 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrtm1Q8K377 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrtm1Q8K377 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrtm1Q8K377 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrtm1Q8K377 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrtm1Q8K377 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrtm1Q8K377 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrtm1Q8K377 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrtm1Q8K377 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrtm1Q8K377 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrtm1Q8K377 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrtm1Q8K377 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrtm1Q8K377 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrtm1Q8K377 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrtm1Q8K377 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrtm1Q8K377 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrtm1Q8K377 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrtm1Q8K377 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrtm1Q8K377 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrtm1Q8K377 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrrtm1Q8K377 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrtm1Q8K377 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrtm1Q8K377 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrtm1Q8K377 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrtm1Q8K377 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrtm1Q8K377 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrtm1Q8K377 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrtm1Q8K377 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrtm1Q8K377 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrtm1Q8K377 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrtm1Q8K377 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrtm1Q8K377 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrtm1Q8K377 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrtm1Q8K377 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrtm1Q8K377 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrtm1Q8K377 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrtm1Q8K377 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrtm1Q8K377 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrtm1Q8K377 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrtm1Q8K377 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrtm1Q8K377 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrtm1Q8K377 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrtm1Q8K377 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrtm1Q8K377 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrtm1Q8K377 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrtm1Q8K377 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrtm1Q8K377 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrtm1Q8K377 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrtm1Q8K377 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrtm1Q8K377 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrtm1Q8K377 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms