Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F8

Lsm14a, Protein LSM14 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm14aQ8K2F8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lsm14aQ8K2F8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lsm14aQ8K2F8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lsm14aQ8K2F8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lsm14aQ8K2F8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lsm14aQ8K2F8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lsm14aQ8K2F8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lsm14aQ8K2F8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lsm14aQ8K2F8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lsm14aQ8K2F8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lsm14aQ8K2F8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lsm14aQ8K2F8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lsm14aQ8K2F8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lsm14aQ8K2F8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lsm14aQ8K2F8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lsm14aQ8K2F8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lsm14aQ8K2F8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lsm14aQ8K2F8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lsm14aQ8K2F8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lsm14aQ8K2F8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lsm14aQ8K2F8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lsm14aQ8K2F8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lsm14aQ8K2F8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lsm14aQ8K2F8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lsm14aQ8K2F8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lsm14aQ8K2F8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lsm14aQ8K2F8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lsm14aQ8K2F8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lsm14aQ8K2F8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lsm14aQ8K2F8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lsm14aQ8K2F8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lsm14aQ8K2F8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lsm14aQ8K2F8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lsm14aQ8K2F8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lsm14aQ8K2F8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lsm14aQ8K2F8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lsm14aQ8K2F8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lsm14aQ8K2F8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lsm14aQ8K2F8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsm14aQ8K2F8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsm14aQ8K2F8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsm14aQ8K2F8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsm14aQ8K2F8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsm14aQ8K2F8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsm14aQ8K2F8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsm14aQ8K2F8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsm14aQ8K2F8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lsm14aQ8K2F8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lsm14aQ8K2F8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lsm14aQ8K2F8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lsm14aQ8K2F8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lsm14aQ8K2F8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lsm14aQ8K2F8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lsm14aQ8K2F8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lsm14aQ8K2F8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lsm14aQ8K2F8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lsm14aQ8K2F8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lsm14aQ8K2F8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lsm14aQ8K2F8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lsm14aQ8K2F8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lsm14aQ8K2F8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lsm14aQ8K2F8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lsm14aQ8K2F8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lsm14aQ8K2F8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lsm14aQ8K2F8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lsm14aQ8K2F8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lsm14aQ8K2F8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lsm14aQ8K2F8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lsm14aQ8K2F8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lsm14aQ8K2F8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lsm14aQ8K2F8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lsm14aQ8K2F8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lsm14aQ8K2F8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lsm14aQ8K2F8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lsm14aQ8K2F8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lsm14aQ8K2F8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lsm14aQ8K2F8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms