Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
H2-Q4Q8HWB2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
H2-Q4Q8HWB2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
H2-Q4Q8HWB2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
H2-Q4Q8HWB2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
H2-Q4Q8HWB2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
H2-Q4Q8HWB2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
H2-Q4Q8HWB2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
H2-Q4Q8HWB2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
H2-Q4Q8HWB2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
H2-Q4Q8HWB2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
H2-Q4Q8HWB2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
H2-Q4Q8HWB2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
H2-Q4Q8HWB2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
H2-Q4Q8HWB2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
H2-Q4Q8HWB2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
H2-Q4Q8HWB2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
H2-Q4Q8HWB2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
H2-Q4Q8HWB2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
H2-Q4Q8HWB2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
H2-Q4Q8HWB2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
H2-Q4Q8HWB2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
H2-Q4Q8HWB2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
H2-Q4Q8HWB2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
H2-Q4Q8HWB2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
H2-Q4Q8HWB2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
H2-Q4Q8HWB2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
H2-Q4Q8HWB2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
H2-Q4Q8HWB2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
H2-Q4Q8HWB2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
H2-Q4Q8HWB2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
H2-Q4Q8HWB2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
H2-Q4Q8HWB2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
H2-Q4Q8HWB2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
H2-Q4Q8HWB2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
H2-Q4Q8HWB2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
H2-Q4Q8HWB2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
H2-Q4Q8HWB2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
H2-Q4Q8HWB2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
H2-Q4Q8HWB2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
H2-Q4Q8HWB2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
H2-Q4Q8HWB2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
H2-Q4Q8HWB2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
H2-Q4Q8HWB2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
H2-Q4Q8HWB2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
H2-Q4Q8HWB2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
H2-Q4Q8HWB2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
H2-Q4Q8HWB2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
H2-Q4Q8HWB2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
H2-Q4Q8HWB2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
H2-Q4Q8HWB2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
H2-Q4Q8HWB2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
H2-Q4Q8HWB2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
H2-Q4Q8HWB2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
H2-Q4Q8HWB2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
H2-Q4Q8HWB2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
H2-Q4Q8HWB2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
H2-Q4Q8HWB2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
H2-Q4Q8HWB2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
H2-Q4Q8HWB2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
H2-Q4Q8HWB2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
H2-Q4Q8HWB2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
H2-Q4Q8HWB2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
H2-Q4Q8HWB2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
H2-Q4Q8HWB2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
H2-Q4Q8HWB2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
H2-Q4Q8HWB2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
H2-Q4Q8HWB2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
H2-Q4Q8HWB2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
H2-Q4Q8HWB2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
H2-Q4Q8HWB2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
H2-Q4Q8HWB2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
H2-Q4Q8HWB2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
H2-Q4Q8HWB2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
H2-Q4Q8HWB2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
H2-Q4Q8HWB2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
H2-Q4Q8HWB2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
H2-Q4Q8HWB2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
H2-Q4Q8HWB2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
H2-Q4Q8HWB2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
H2-Q4Q8HWB2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
H2-Q4Q8HWB2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
H2-Q4Q8HWB2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
H2-Q4Q8HWB2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
H2-Q4Q8HWB2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
H2-Q4Q8HWB2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
H2-Q4Q8HWB2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
H2-Q4Q8HWB2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
H2-Q4Q8HWB2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
H2-Q4Q8HWB2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
H2-Q4Q8HWB2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H2-Q4Q8HWB2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H2-Q4Q8HWB2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H2-Q4Q8HWB2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
H2-Q4Q8HWB2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
H2-Q4Q8HWB2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
H2-Q4Q8HWB2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
H2-Q4Q8HWB2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
H2-Q4Q8HWB2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
H2-Q4Q8HWB2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms