Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx30Q8CE50 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx30Q8CE50 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx30Q8CE50 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx30Q8CE50 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx30Q8CE50 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx30Q8CE50 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx30Q8CE50 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx30Q8CE50 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx30Q8CE50 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx30Q8CE50 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx30Q8CE50 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx30Q8CE50 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx30Q8CE50 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx30Q8CE50 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx30Q8CE50 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx30Q8CE50 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snx30Q8CE50 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snx30Q8CE50 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snx30Q8CE50 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx30Q8CE50 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx30Q8CE50 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx30Q8CE50 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx30Q8CE50 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx30Q8CE50 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx30Q8CE50 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx30Q8CE50 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx30Q8CE50 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx30Q8CE50 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Snx30Q8CE50 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx30Q8CE50 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx30Q8CE50 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx30Q8CE50 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx30Q8CE50 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx30Q8CE50 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx30Q8CE50 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx30Q8CE50 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx30Q8CE50 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx30Q8CE50 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx30Q8CE50 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx30Q8CE50 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx30Q8CE50 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx30Q8CE50 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx30Q8CE50 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx30Q8CE50 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx30Q8CE50 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx30Q8CE50 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx30Q8CE50 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx30Q8CE50 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx30Q8CE50 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx30Q8CE50 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx30Q8CE50 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx30Q8CE50 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx30Q8CE50 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx30Q8CE50 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx30Q8CE50 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx30Q8CE50 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx30Q8CE50 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx30Q8CE50 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx30Q8CE50 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx30Q8CE50 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx30Q8CE50 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx30Q8CE50 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx30Q8CE50 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx30Q8CE50 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx30Q8CE50 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx30Q8CE50 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx30Q8CE50 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx30Q8CE50 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx30Q8CE50 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx30Q8CE50 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx30Q8CE50 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx30Q8CE50 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx30Q8CE50 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx30Q8CE50 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx30Q8CE50 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx30Q8CE50 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx30Q8CE50 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx30Q8CE50 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snx30Q8CE50 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snx30Q8CE50 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx30Q8CE50 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx30Q8CE50 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx30Q8CE50 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx30Q8CE50 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx30Q8CE50 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx30Q8CE50 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx30Q8CE50 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx30Q8CE50 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx30Q8CE50 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx30Q8CE50 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx30Q8CE50 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx30Q8CE50 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx30Q8CE50 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx30Q8CE50 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx30Q8CE50 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx30Q8CE50 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx30Q8CE50 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx30Q8CE50 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx30Q8CE50 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms