Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vcpip1Q8CDG3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vcpip1Q8CDG3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Vcpip1Q8CDG3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vcpip1Q8CDG3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vcpip1Q8CDG3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vcpip1Q8CDG3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vcpip1Q8CDG3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vcpip1Q8CDG3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vcpip1Q8CDG3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vcpip1Q8CDG3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vcpip1Q8CDG3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vcpip1Q8CDG3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vcpip1Q8CDG3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Vcpip1Q8CDG3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vcpip1Q8CDG3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vcpip1Q8CDG3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vcpip1Q8CDG3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vcpip1Q8CDG3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vcpip1Q8CDG3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vcpip1Q8CDG3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vcpip1Q8CDG3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vcpip1Q8CDG3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vcpip1Q8CDG3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vcpip1Q8CDG3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vcpip1Q8CDG3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vcpip1Q8CDG3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vcpip1Q8CDG3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vcpip1Q8CDG3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vcpip1Q8CDG3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vcpip1Q8CDG3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vcpip1Q8CDG3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vcpip1Q8CDG3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Vcpip1Q8CDG3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Vcpip1Q8CDG3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vcpip1Q8CDG3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vcpip1Q8CDG3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vcpip1Q8CDG3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vcpip1Q8CDG3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Vcpip1Q8CDG3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vcpip1Q8CDG3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vcpip1Q8CDG3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vcpip1Q8CDG3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vcpip1Q8CDG3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Vcpip1Q8CDG3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vcpip1Q8CDG3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vcpip1Q8CDG3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vcpip1Q8CDG3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vcpip1Q8CDG3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vcpip1Q8CDG3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vcpip1Q8CDG3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vcpip1Q8CDG3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vcpip1Q8CDG3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vcpip1Q8CDG3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vcpip1Q8CDG3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vcpip1Q8CDG3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vcpip1Q8CDG3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vcpip1Q8CDG3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vcpip1Q8CDG3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vcpip1Q8CDG3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vcpip1Q8CDG3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vcpip1Q8CDG3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vcpip1Q8CDG3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Vcpip1Q8CDG3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vcpip1Q8CDG3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vcpip1Q8CDG3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vcpip1Q8CDG3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vcpip1Q8CDG3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vcpip1Q8CDG3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vcpip1Q8CDG3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vcpip1Q8CDG3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Vcpip1Q8CDG3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Vcpip1Q8CDG3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vcpip1Q8CDG3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vcpip1Q8CDG3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vcpip1Q8CDG3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vcpip1Q8CDG3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vcpip1Q8CDG3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vcpip1Q8CDG3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vcpip1Q8CDG3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vcpip1Q8CDG3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vcpip1Q8CDG3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vcpip1Q8CDG3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vcpip1Q8CDG3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Vcpip1Q8CDG3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vcpip1Q8CDG3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vcpip1Q8CDG3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vcpip1Q8CDG3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vcpip1Q8CDG3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vcpip1Q8CDG3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Vcpip1Q8CDG3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vcpip1Q8CDG3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vcpip1Q8CDG3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vcpip1Q8CDG3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vcpip1Q8CDG3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vcpip1Q8CDG3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vcpip1Q8CDG3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vcpip1Q8CDG3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vcpip1Q8CDG3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vcpip1Q8CDG3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms