Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ckap4Q8BMK4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ckap4Q8BMK4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ckap4Q8BMK4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ckap4Q8BMK4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ckap4Q8BMK4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ckap4Q8BMK4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ckap4Q8BMK4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ckap4Q8BMK4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ckap4Q8BMK4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ckap4Q8BMK4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ckap4Q8BMK4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ckap4Q8BMK4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ckap4Q8BMK4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ckap4Q8BMK4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap4Q8BMK4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap4Q8BMK4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap4Q8BMK4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckap4Q8BMK4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckap4Q8BMK4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckap4Q8BMK4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckap4Q8BMK4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ckap4Q8BMK4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ckap4Q8BMK4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ckap4Q8BMK4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ckap4Q8BMK4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ckap4Q8BMK4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ckap4Q8BMK4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap4Q8BMK4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap4Q8BMK4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap4Q8BMK4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap4Q8BMK4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap4Q8BMK4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap4Q8BMK4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap4Q8BMK4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ckap4Q8BMK4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ckap4Q8BMK4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ckap4Q8BMK4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ckap4Q8BMK4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ckap4Q8BMK4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ckap4Q8BMK4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ckap4Q8BMK4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ckap4Q8BMK4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ckap4Q8BMK4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ckap4Q8BMK4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap4Q8BMK4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap4Q8BMK4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap4Q8BMK4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap4Q8BMK4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap4Q8BMK4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ckap4Q8BMK4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ckap4Q8BMK4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckap4Q8BMK4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckap4Q8BMK4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckap4Q8BMK4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ckap4Q8BMK4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ckap4Q8BMK4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ckap4Q8BMK4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ckap4Q8BMK4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ckap4Q8BMK4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ckap4Q8BMK4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ckap4Q8BMK4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckap4Q8BMK4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckap4Q8BMK4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckap4Q8BMK4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckap4Q8BMK4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckap4Q8BMK4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap4Q8BMK4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap4Q8BMK4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckap4Q8BMK4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckap4Q8BMK4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ckap4Q8BMK4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ckap4Q8BMK4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ckap4Q8BMK4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ckap4Q8BMK4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ckap4Q8BMK4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap4Q8BMK4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap4Q8BMK4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckap4Q8BMK4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckap4Q8BMK4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckap4Q8BMK4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckap4Q8BMK4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckap4Q8BMK4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ckap4Q8BMK4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ckap4Q8BMK4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap4Q8BMK4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckap4Q8BMK4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckap4Q8BMK4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ckap4Q8BMK4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap4Q8BMK4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap4Q8BMK4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap4Q8BMK4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap4Q8BMK4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap4Q8BMK4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ckap4Q8BMK4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ckap4Q8BMK4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap4Q8BMK4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap4Q8BMK4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap4Q8BMK4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap4Q8BMK4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms