Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLR5

Psd4, PH and SEC7 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,005 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psd4Q8BLR5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psd4Q8BLR5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psd4Q8BLR5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psd4Q8BLR5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psd4Q8BLR5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psd4Q8BLR5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psd4Q8BLR5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psd4Q8BLR5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psd4Q8BLR5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psd4Q8BLR5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psd4Q8BLR5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psd4Q8BLR5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psd4Q8BLR5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psd4Q8BLR5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psd4Q8BLR5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psd4Q8BLR5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psd4Q8BLR5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psd4Q8BLR5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psd4Q8BLR5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psd4Q8BLR5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psd4Q8BLR5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psd4Q8BLR5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psd4Q8BLR5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psd4Q8BLR5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psd4Q8BLR5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psd4Q8BLR5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psd4Q8BLR5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psd4Q8BLR5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psd4Q8BLR5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psd4Q8BLR5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psd4Q8BLR5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psd4Q8BLR5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psd4Q8BLR5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psd4Q8BLR5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psd4Q8BLR5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psd4Q8BLR5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psd4Q8BLR5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psd4Q8BLR5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psd4Q8BLR5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psd4Q8BLR5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psd4Q8BLR5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psd4Q8BLR5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Psd4Q8BLR5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Psd4Q8BLR5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psd4Q8BLR5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psd4Q8BLR5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psd4Q8BLR5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psd4Q8BLR5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psd4Q8BLR5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psd4Q8BLR5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psd4Q8BLR5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psd4Q8BLR5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psd4Q8BLR5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psd4Q8BLR5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psd4Q8BLR5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psd4Q8BLR5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psd4Q8BLR5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psd4Q8BLR5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psd4Q8BLR5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psd4Q8BLR5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psd4Q8BLR5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psd4Q8BLR5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psd4Q8BLR5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psd4Q8BLR5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psd4Q8BLR5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psd4Q8BLR5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psd4Q8BLR5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psd4Q8BLR5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psd4Q8BLR5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psd4Q8BLR5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psd4Q8BLR5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psd4Q8BLR5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Psd4Q8BLR5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Psd4Q8BLR5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psd4Q8BLR5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psd4Q8BLR5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psd4Q8BLR5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms