Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gcfc2Q8BKT3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gcfc2Q8BKT3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gcfc2Q8BKT3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gcfc2Q8BKT3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gcfc2Q8BKT3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gcfc2Q8BKT3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gcfc2Q8BKT3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gcfc2Q8BKT3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gcfc2Q8BKT3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gcfc2Q8BKT3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gcfc2Q8BKT3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gcfc2Q8BKT3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gcfc2Q8BKT3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gcfc2Q8BKT3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gcfc2Q8BKT3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gcfc2Q8BKT3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gcfc2Q8BKT3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gcfc2Q8BKT3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gcfc2Q8BKT3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gcfc2Q8BKT3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gcfc2Q8BKT3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gcfc2Q8BKT3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gcfc2Q8BKT3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gcfc2Q8BKT3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gcfc2Q8BKT3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gcfc2Q8BKT3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gcfc2Q8BKT3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gcfc2Q8BKT3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gcfc2Q8BKT3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gcfc2Q8BKT3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gcfc2Q8BKT3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gcfc2Q8BKT3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gcfc2Q8BKT3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gcfc2Q8BKT3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gcfc2Q8BKT3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gcfc2Q8BKT3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gcfc2Q8BKT3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gcfc2Q8BKT3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gcfc2Q8BKT3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gcfc2Q8BKT3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gcfc2Q8BKT3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gcfc2Q8BKT3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gcfc2Q8BKT3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gcfc2Q8BKT3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gcfc2Q8BKT3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gcfc2Q8BKT3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gcfc2Q8BKT3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gcfc2Q8BKT3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gcfc2Q8BKT3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gcfc2Q8BKT3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gcfc2Q8BKT3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcfc2Q8BKT3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gcfc2Q8BKT3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gcfc2Q8BKT3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gcfc2Q8BKT3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gcfc2Q8BKT3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcfc2Q8BKT3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcfc2Q8BKT3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcfc2Q8BKT3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcfc2Q8BKT3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcfc2Q8BKT3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gcfc2Q8BKT3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gcfc2Q8BKT3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gcfc2Q8BKT3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gcfc2Q8BKT3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gcfc2Q8BKT3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gcfc2Q8BKT3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gcfc2Q8BKT3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gcfc2Q8BKT3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcfc2Q8BKT3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcfc2Q8BKT3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcfc2Q8BKT3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcfc2Q8BKT3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcfc2Q8BKT3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcfc2Q8BKT3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gcfc2Q8BKT3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcfc2Q8BKT3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms