Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Htatsf1Q8BGC0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Htatsf1Q8BGC0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Htatsf1Q8BGC0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Htatsf1Q8BGC0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Htatsf1Q8BGC0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Htatsf1Q8BGC0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Htatsf1Q8BGC0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Htatsf1Q8BGC0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Htatsf1Q8BGC0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Htatsf1Q8BGC0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Htatsf1Q8BGC0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Htatsf1Q8BGC0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Htatsf1Q8BGC0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Htatsf1Q8BGC0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Htatsf1Q8BGC0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Htatsf1Q8BGC0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Htatsf1Q8BGC0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Htatsf1Q8BGC0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Htatsf1Q8BGC0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Htatsf1Q8BGC0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Htatsf1Q8BGC0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Htatsf1Q8BGC0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Htatsf1Q8BGC0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Htatsf1Q8BGC0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Htatsf1Q8BGC0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Htatsf1Q8BGC0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Htatsf1Q8BGC0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Htatsf1Q8BGC0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Htatsf1Q8BGC0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Htatsf1Q8BGC0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Htatsf1Q8BGC0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Htatsf1Q8BGC0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Htatsf1Q8BGC0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Htatsf1Q8BGC0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Htatsf1Q8BGC0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Htatsf1Q8BGC0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Htatsf1Q8BGC0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Htatsf1Q8BGC0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Htatsf1Q8BGC0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Htatsf1Q8BGC0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Htatsf1Q8BGC0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Htatsf1Q8BGC0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Htatsf1Q8BGC0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Htatsf1Q8BGC0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Htatsf1Q8BGC0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Htatsf1Q8BGC0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Htatsf1Q8BGC0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Htatsf1Q8BGC0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Htatsf1Q8BGC0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Htatsf1Q8BGC0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Htatsf1Q8BGC0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Htatsf1Q8BGC0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Htatsf1Q8BGC0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Htatsf1Q8BGC0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Htatsf1Q8BGC0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Htatsf1Q8BGC0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Htatsf1Q8BGC0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Htatsf1Q8BGC0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Htatsf1Q8BGC0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Htatsf1Q8BGC0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Htatsf1Q8BGC0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Htatsf1Q8BGC0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Htatsf1Q8BGC0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Htatsf1Q8BGC0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Htatsf1Q8BGC0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Htatsf1Q8BGC0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Htatsf1Q8BGC0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Htatsf1Q8BGC0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Htatsf1Q8BGC0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Htatsf1Q8BGC0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Htatsf1Q8BGC0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Htatsf1Q8BGC0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms