Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIC6

Atp1a3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a3Q6PIC6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp1a3Q6PIC6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp1a3Q6PIC6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp1a3Q6PIC6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp1a3Q6PIC6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp1a3Q6PIC6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp1a3Q6PIC6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp1a3Q6PIC6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1a3Q6PIC6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1a3Q6PIC6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1a3Q6PIC6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1a3Q6PIC6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1a3Q6PIC6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1a3Q6PIC6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp1a3Q6PIC6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp1a3Q6PIC6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp1a3Q6PIC6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp1a3Q6PIC6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp1a3Q6PIC6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp1a3Q6PIC6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Atp1a3Q6PIC6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp1a3Q6PIC6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp1a3Q6PIC6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1a3Q6PIC6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1a3Q6PIC6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1a3Q6PIC6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1a3Q6PIC6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp1a3Q6PIC6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp1a3Q6PIC6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp1a3Q6PIC6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp1a3Q6PIC6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp1a3Q6PIC6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp1a3Q6PIC6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp1a3Q6PIC6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp1a3Q6PIC6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp1a3Q6PIC6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp1a3Q6PIC6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp1a3Q6PIC6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp1a3Q6PIC6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp1a3Q6PIC6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp1a3Q6PIC6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp1a3Q6PIC6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp1a3Q6PIC6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Atp1a3Q6PIC6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp1a3Q6PIC6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp1a3Q6PIC6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Atp1a3Q6PIC6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp1a3Q6PIC6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1a3Q6PIC6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1a3Q6PIC6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp1a3Q6PIC6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp1a3Q6PIC6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp1a3Q6PIC6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp1a3Q6PIC6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp1a3Q6PIC6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1a3Q6PIC6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1a3Q6PIC6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp1a3Q6PIC6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp1a3Q6PIC6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp1a3Q6PIC6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp1a3Q6PIC6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp1a3Q6PIC6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp1a3Q6PIC6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp1a3Q6PIC6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1a3Q6PIC6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1a3Q6PIC6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1a3Q6PIC6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp1a3Q6PIC6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp1a3Q6PIC6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp1a3Q6PIC6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp1a3Q6PIC6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1a3Q6PIC6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1a3Q6PIC6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1a3Q6PIC6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1a3Q6PIC6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1a3Q6PIC6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1a3Q6PIC6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp1a3Q6PIC6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp1a3Q6PIC6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp1a3Q6PIC6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp1a3Q6PIC6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp1a3Q6PIC6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp1a3Q6PIC6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp1a3Q6PIC6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp1a3Q6PIC6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp1a3Q6PIC6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp1a3Q6PIC6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp1a3Q6PIC6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp1a3Q6PIC6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp1a3Q6PIC6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp1a3Q6PIC6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp1a3Q6PIC6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp1a3Q6PIC6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp1a3Q6PIC6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp1a3Q6PIC6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp1a3Q6PIC6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp1a3Q6PIC6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp1a3Q6PIC6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp1a3Q6PIC6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp1a3Q6PIC6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms