Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Fbxo41Q6NS60 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Fbxo41Q6NS60 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Fbxo41Q6NS60 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Fbxo41Q6NS60 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Fbxo41Q6NS60 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Fbxo41Q6NS60 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Fbxo41Q6NS60 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Fbxo41Q6NS60 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Fbxo41Q6NS60 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Fbxo41Q6NS60 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Fbxo41Q6NS60 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Fbxo41Q6NS60 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Fbxo41Q6NS60 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Fbxo41Q6NS60 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Fbxo41Q6NS60 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Fbxo41Q6NS60 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Fbxo41Q6NS60 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Fbxo41Q6NS60 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Fbxo41Q6NS60 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Fbxo41Q6NS60 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Fbxo41Q6NS60 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Fbxo41Q6NS60 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Fbxo41Q6NS60 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Fbxo41Q6NS60 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Fbxo41Q6NS60 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Fbxo41Q6NS60 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Fbxo41Q6NS60 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fbxo41Q6NS60 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fbxo41Q6NS60 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fbxo41Q6NS60 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fbxo41Q6NS60 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Fbxo41Q6NS60 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Fbxo41Q6NS60 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Fbxo41Q6NS60 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Fbxo41Q6NS60 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Fbxo41Q6NS60 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Fbxo41Q6NS60 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Fbxo41Q6NS60 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Fbxo41Q6NS60 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Fbxo41Q6NS60 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Fbxo41Q6NS60 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Fbxo41Q6NS60 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Fbxo41Q6NS60 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Fbxo41Q6NS60 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Fbxo41Q6NS60 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Fbxo41Q6NS60 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Fbxo41Q6NS60 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Fbxo41Q6NS60 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Fbxo41Q6NS60 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Fbxo41Q6NS60 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Fbxo41Q6NS60 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Fbxo41Q6NS60 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Fbxo41Q6NS60 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Fbxo41Q6NS60 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Fbxo41Q6NS60 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Fbxo41Q6NS60 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Fbxo41Q6NS60 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Fbxo41Q6NS60 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Fbxo41Q6NS60 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Fbxo41Q6NS60 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Fbxo41Q6NS60 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Fbxo41Q6NS60 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Fbxo41Q6NS60 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Fbxo41Q6NS60 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Fbxo41Q6NS60 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Fbxo41Q6NS60 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Fbxo41Q6NS60 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Fbxo41Q6NS60 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Fbxo41Q6NS60 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Fbxo41Q6NS60 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Fbxo41Q6NS60 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Fbxo41Q6NS60 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Fbxo41Q6NS60 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Fbxo41Q6NS60 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Fbxo41Q6NS60 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Fbxo41Q6NS60 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
Fbxo41Q6NS60 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Fbxo41Q6NS60 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Fbxo41Q6NS60 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Fbxo41Q6NS60 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Fbxo41Q6NS60 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Fbxo41Q6NS60 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Fbxo41Q6NS60 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Fbxo41Q6NS60 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Fbxo41Q6NS60 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Fbxo41Q6NS60 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Fbxo41Q6NS60 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Fbxo41Q6NS60 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Fbxo41Q6NS60 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Fbxo41Q6NS60 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Fbxo41Q6NS60 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Fbxo41Q6NS60 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Fbxo41Q6NS60 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Fbxo41Q6NS60 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Fbxo41Q6NS60 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Fbxo41Q6NS60 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Fbxo41Q6NS60 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Fbxo41Q6NS60 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Fbxo41Q6NS60 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms