Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cep290Q6A078 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cep290Q6A078 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cep290Q6A078 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cep290Q6A078 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cep290Q6A078 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cep290Q6A078 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cep290Q6A078 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cep290Q6A078 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cep290Q6A078 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cep290Q6A078 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cep290Q6A078 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cep290Q6A078 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cep290Q6A078 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cep290Q6A078 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cep290Q6A078 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cep290Q6A078 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cep290Q6A078 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cep290Q6A078 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cep290Q6A078 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cep290Q6A078 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cep290Q6A078 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cep290Q6A078 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cep290Q6A078 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cep290Q6A078 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cep290Q6A078 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cep290Q6A078 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cep290Q6A078 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cep290Q6A078 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cep290Q6A078 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cep290Q6A078 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cep290Q6A078 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cep290Q6A078 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cep290Q6A078 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cep290Q6A078 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cep290Q6A078 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cep290Q6A078 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cep290Q6A078 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cep290Q6A078 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cep290Q6A078 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cep290Q6A078 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cep290Q6A078 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cep290Q6A078 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cep290Q6A078 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cep290Q6A078 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cep290Q6A078 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cep290Q6A078 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cep290Q6A078 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cep290Q6A078 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cep290Q6A078 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cep290Q6A078 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cep290Q6A078 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cep290Q6A078 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cep290Q6A078 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep290Q6A078 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep290Q6A078 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cep290Q6A078 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cep290Q6A078 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cep290Q6A078 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cep290Q6A078 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cep290Q6A078 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cep290Q6A078 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cep290Q6A078 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cep290Q6A078 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cep290Q6A078 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cep290Q6A078 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cep290Q6A078 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep290Q6A078 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep290Q6A078 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep290Q6A078 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep290Q6A078 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep290Q6A078 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cep290Q6A078 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cep290Q6A078 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cep290Q6A078 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cep290Q6A078 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cep290Q6A078 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cep290Q6A078 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cep290Q6A078 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cep290Q6A078 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep290Q6A078 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cep290Q6A078 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cep290Q6A078 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cep290Q6A078 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cep290Q6A078 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cep290Q6A078 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cep290Q6A078 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep290Q6A078 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep290Q6A078 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep290Q6A078 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep290Q6A078 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep290Q6A078 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cep290Q6A078 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cep290Q6A078 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cep290Q6A078 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cep290Q6A078 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cep290Q6A078 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep290Q6A078 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep290Q6A078 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep290Q6A078 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
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