Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC080695Q66JY9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC080695Q66JY9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC080695Q66JY9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC080695Q66JY9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC080695Q66JY9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC080695Q66JY9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC080695Q66JY9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BC080695Q66JY9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC080695Q66JY9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC080695Q66JY9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC080695Q66JY9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC080695Q66JY9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BC080695Q66JY9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC080695Q66JY9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC080695Q66JY9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BC080695Q66JY9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC080695Q66JY9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC080695Q66JY9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC080695Q66JY9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC080695Q66JY9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BC080695Q66JY9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC080695Q66JY9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC080695Q66JY9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC080695Q66JY9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC080695Q66JY9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC080695Q66JY9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC080695Q66JY9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC080695Q66JY9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC080695Q66JY9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BC080695Q66JY9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC080695Q66JY9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC080695Q66JY9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC080695Q66JY9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC080695Q66JY9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC080695Q66JY9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC080695Q66JY9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC080695Q66JY9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC080695Q66JY9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC080695Q66JY9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC080695Q66JY9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BC080695Q66JY9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC080695Q66JY9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC080695Q66JY9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC080695Q66JY9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC080695Q66JY9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC080695Q66JY9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC080695Q66JY9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC080695Q66JY9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC080695Q66JY9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC080695Q66JY9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC080695Q66JY9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC080695Q66JY9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC080695Q66JY9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC080695Q66JY9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC080695Q66JY9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC080695Q66JY9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC080695Q66JY9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC080695Q66JY9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC080695Q66JY9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC080695Q66JY9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC080695Q66JY9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC080695Q66JY9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC080695Q66JY9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC080695Q66JY9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC080695Q66JY9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC080695Q66JY9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC080695Q66JY9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BC080695Q66JY9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BC080695Q66JY9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BC080695Q66JY9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC080695Q66JY9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BC080695Q66JY9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC080695Q66JY9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC080695Q66JY9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC080695Q66JY9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC080695Q66JY9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC080695Q66JY9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms