Protein–RNA interactions for Protein: Q64436

Atp4a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp4aQ64436 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp4aQ64436 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp4aQ64436 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp4aQ64436 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp4aQ64436 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp4aQ64436 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp4aQ64436 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp4aQ64436 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp4aQ64436 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp4aQ64436 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp4aQ64436 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp4aQ64436 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp4aQ64436 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp4aQ64436 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp4aQ64436 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp4aQ64436 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp4aQ64436 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp4aQ64436 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp4aQ64436 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp4aQ64436 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp4aQ64436 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp4aQ64436 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp4aQ64436 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp4aQ64436 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp4aQ64436 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp4aQ64436 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp4aQ64436 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp4aQ64436 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp4aQ64436 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp4aQ64436 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp4aQ64436 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp4aQ64436 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp4aQ64436 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atp4aQ64436 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp4aQ64436 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp4aQ64436 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp4aQ64436 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp4aQ64436 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp4aQ64436 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp4aQ64436 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp4aQ64436 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp4aQ64436 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp4aQ64436 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp4aQ64436 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atp4aQ64436 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp4aQ64436 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp4aQ64436 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp4aQ64436 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp4aQ64436 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp4aQ64436 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp4aQ64436 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp4aQ64436 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp4aQ64436 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp4aQ64436 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp4aQ64436 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp4aQ64436 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp4aQ64436 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp4aQ64436 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp4aQ64436 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp4aQ64436 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp4aQ64436 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp4aQ64436 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp4aQ64436 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp4aQ64436 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp4aQ64436 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp4aQ64436 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp4aQ64436 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp4aQ64436 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp4aQ64436 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp4aQ64436 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp4aQ64436 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp4aQ64436 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp4aQ64436 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp4aQ64436 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp4aQ64436 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp4aQ64436 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms