Protein–RNA interactions for Protein: Q62230

Siglec1, Sialoadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siglec1Q62230 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Siglec1Q62230 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Siglec1Q62230 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Siglec1Q62230 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Siglec1Q62230 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Siglec1Q62230 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Siglec1Q62230 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Siglec1Q62230 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Siglec1Q62230 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Siglec1Q62230 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Siglec1Q62230 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Siglec1Q62230 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Siglec1Q62230 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Siglec1Q62230 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Siglec1Q62230 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Siglec1Q62230 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Siglec1Q62230 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Siglec1Q62230 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Siglec1Q62230 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Siglec1Q62230 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Siglec1Q62230 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Siglec1Q62230 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Siglec1Q62230 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Siglec1Q62230 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Siglec1Q62230 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Siglec1Q62230 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Siglec1Q62230 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Siglec1Q62230 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Siglec1Q62230 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Siglec1Q62230 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Siglec1Q62230 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Siglec1Q62230 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Siglec1Q62230 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Siglec1Q62230 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Siglec1Q62230 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Siglec1Q62230 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Siglec1Q62230 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Siglec1Q62230 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Siglec1Q62230 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Siglec1Q62230 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Siglec1Q62230 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Siglec1Q62230 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Siglec1Q62230 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Siglec1Q62230 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Siglec1Q62230 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Siglec1Q62230 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Siglec1Q62230 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Siglec1Q62230 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Siglec1Q62230 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Siglec1Q62230 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Siglec1Q62230 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Siglec1Q62230 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Siglec1Q62230 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Siglec1Q62230 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Siglec1Q62230 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Siglec1Q62230 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Siglec1Q62230 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Siglec1Q62230 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Siglec1Q62230 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Siglec1Q62230 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Siglec1Q62230 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Siglec1Q62230 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Siglec1Q62230 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Siglec1Q62230 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Siglec1Q62230 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Siglec1Q62230 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Siglec1Q62230 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Siglec1Q62230 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Siglec1Q62230 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Siglec1Q62230 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Siglec1Q62230 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Siglec1Q62230 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Siglec1Q62230 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Siglec1Q62230 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Siglec1Q62230 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Siglec1Q62230 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Siglec1Q62230 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Siglec1Q62230 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Siglec1Q62230 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Siglec1Q62230 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Siglec1Q62230 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Siglec1Q62230 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Siglec1Q62230 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Siglec1Q62230 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Siglec1Q62230 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Siglec1Q62230 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Siglec1Q62230 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Siglec1Q62230 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Siglec1Q62230 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Siglec1Q62230 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Siglec1Q62230 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Siglec1Q62230 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Siglec1Q62230 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Siglec1Q62230 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.89
Siglec1Q62230 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Siglec1Q62230 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Siglec1Q62230 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Siglec1Q62230 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Siglec1Q62230 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Siglec1Q62230 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms