Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Pacsin1Q61644 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pacsin1Q61644 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pacsin1Q61644 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pacsin1Q61644 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pacsin1Q61644 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pacsin1Q61644 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pacsin1Q61644 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pacsin1Q61644 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pacsin1Q61644 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pacsin1Q61644 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pacsin1Q61644 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pacsin1Q61644 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pacsin1Q61644 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pacsin1Q61644 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pacsin1Q61644 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pacsin1Q61644 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pacsin1Q61644 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pacsin1Q61644 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Pacsin1Q61644 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pacsin1Q61644 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pacsin1Q61644 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pacsin1Q61644 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pacsin1Q61644 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pacsin1Q61644 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pacsin1Q61644 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pacsin1Q61644 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pacsin1Q61644 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pacsin1Q61644 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pacsin1Q61644 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pacsin1Q61644 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pacsin1Q61644 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pacsin1Q61644 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pacsin1Q61644 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pacsin1Q61644 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pacsin1Q61644 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pacsin1Q61644 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pacsin1Q61644 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pacsin1Q61644 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pacsin1Q61644 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pacsin1Q61644 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pacsin1Q61644 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pacsin1Q61644 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pacsin1Q61644 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pacsin1Q61644 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pacsin1Q61644 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pacsin1Q61644 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Pacsin1Q61644 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Pacsin1Q61644 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pacsin1Q61644 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pacsin1Q61644 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pacsin1Q61644 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pacsin1Q61644 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pacsin1Q61644 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pacsin1Q61644 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pacsin1Q61644 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pacsin1Q61644 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pacsin1Q61644 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pacsin1Q61644 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pacsin1Q61644 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pacsin1Q61644 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pacsin1Q61644 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pacsin1Q61644 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pacsin1Q61644 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pacsin1Q61644 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pacsin1Q61644 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pacsin1Q61644 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pacsin1Q61644 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pacsin1Q61644 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Pacsin1Q61644 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pacsin1Q61644 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pacsin1Q61644 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pacsin1Q61644 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pacsin1Q61644 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pacsin1Q61644 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pacsin1Q61644 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pacsin1Q61644 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pacsin1Q61644 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pacsin1Q61644 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pacsin1Q61644 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pacsin1Q61644 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pacsin1Q61644 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pacsin1Q61644 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pacsin1Q61644 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pacsin1Q61644 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pacsin1Q61644 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pacsin1Q61644 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pacsin1Q61644 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pacsin1Q61644 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pacsin1Q61644 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Pacsin1Q61644 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pacsin1Q61644 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pacsin1Q61644 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pacsin1Q61644 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pacsin1Q61644 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pacsin1Q61644 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pacsin1Q61644 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pacsin1Q61644 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pacsin1Q61644 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pacsin1Q61644 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms