Protein–RNA interactions for Protein: Q61183

Papola, Poly(A) polymerase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolaQ61183 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PapolaQ61183 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PapolaQ61183 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PapolaQ61183 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PapolaQ61183 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PapolaQ61183 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PapolaQ61183 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PapolaQ61183 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PapolaQ61183 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PapolaQ61183 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PapolaQ61183 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PapolaQ61183 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PapolaQ61183 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PapolaQ61183 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PapolaQ61183 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PapolaQ61183 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PapolaQ61183 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PapolaQ61183 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PapolaQ61183 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PapolaQ61183 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PapolaQ61183 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PapolaQ61183 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PapolaQ61183 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PapolaQ61183 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PapolaQ61183 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PapolaQ61183 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PapolaQ61183 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PapolaQ61183 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PapolaQ61183 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PapolaQ61183 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PapolaQ61183 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PapolaQ61183 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PapolaQ61183 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PapolaQ61183 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PapolaQ61183 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PapolaQ61183 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PapolaQ61183 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PapolaQ61183 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PapolaQ61183 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PapolaQ61183 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PapolaQ61183 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PapolaQ61183 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PapolaQ61183 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PapolaQ61183 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PapolaQ61183 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PapolaQ61183 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PapolaQ61183 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PapolaQ61183 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PapolaQ61183 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PapolaQ61183 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PapolaQ61183 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PapolaQ61183 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PapolaQ61183 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PapolaQ61183 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PapolaQ61183 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PapolaQ61183 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PapolaQ61183 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PapolaQ61183 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PapolaQ61183 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PapolaQ61183 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PapolaQ61183 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PapolaQ61183 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PapolaQ61183 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PapolaQ61183 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PapolaQ61183 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PapolaQ61183 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PapolaQ61183 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PapolaQ61183 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PapolaQ61183 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PapolaQ61183 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PapolaQ61183 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PapolaQ61183 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PapolaQ61183 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PapolaQ61183 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PapolaQ61183 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PapolaQ61183 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PapolaQ61183 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PapolaQ61183 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PapolaQ61183 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PapolaQ61183 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PapolaQ61183 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PapolaQ61183 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PapolaQ61183 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PapolaQ61183 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PapolaQ61183 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PapolaQ61183 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PapolaQ61183 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PapolaQ61183 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PapolaQ61183 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PapolaQ61183 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PapolaQ61183 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PapolaQ61183 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PapolaQ61183 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PapolaQ61183 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PapolaQ61183 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PapolaQ61183 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PapolaQ61183 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PapolaQ61183 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PapolaQ61183 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PapolaQ61183 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms