Protein–RNA interactions for Protein: Q61048

Wbp4, WW domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wbp4Q61048 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wbp4Q61048 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wbp4Q61048 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wbp4Q61048 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wbp4Q61048 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wbp4Q61048 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wbp4Q61048 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wbp4Q61048 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wbp4Q61048 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wbp4Q61048 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wbp4Q61048 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wbp4Q61048 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wbp4Q61048 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wbp4Q61048 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wbp4Q61048 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wbp4Q61048 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wbp4Q61048 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wbp4Q61048 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wbp4Q61048 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wbp4Q61048 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wbp4Q61048 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wbp4Q61048 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wbp4Q61048 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Wbp4Q61048 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wbp4Q61048 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wbp4Q61048 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wbp4Q61048 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wbp4Q61048 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wbp4Q61048 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wbp4Q61048 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wbp4Q61048 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wbp4Q61048 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wbp4Q61048 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wbp4Q61048 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wbp4Q61048 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wbp4Q61048 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wbp4Q61048 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wbp4Q61048 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Wbp4Q61048 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Wbp4Q61048 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Wbp4Q61048 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Wbp4Q61048 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Wbp4Q61048 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Wbp4Q61048 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Wbp4Q61048 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Wbp4Q61048 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Wbp4Q61048 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wbp4Q61048 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wbp4Q61048 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Wbp4Q61048 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Wbp4Q61048 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Wbp4Q61048 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wbp4Q61048 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wbp4Q61048 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Wbp4Q61048 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wbp4Q61048 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wbp4Q61048 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wbp4Q61048 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wbp4Q61048 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wbp4Q61048 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Wbp4Q61048 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Wbp4Q61048 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Wbp4Q61048 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wbp4Q61048 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wbp4Q61048 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wbp4Q61048 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wbp4Q61048 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wbp4Q61048 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wbp4Q61048 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wbp4Q61048 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wbp4Q61048 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Wbp4Q61048 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.3 ms