Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttf2Q5NC05 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttf2Q5NC05 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ttf2Q5NC05 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ttf2Q5NC05 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ttf2Q5NC05 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ttf2Q5NC05 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ttf2Q5NC05 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ttf2Q5NC05 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ttf2Q5NC05 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ttf2Q5NC05 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ttf2Q5NC05 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttf2Q5NC05 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttf2Q5NC05 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttf2Q5NC05 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttf2Q5NC05 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttf2Q5NC05 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttf2Q5NC05 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttf2Q5NC05 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttf2Q5NC05 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttf2Q5NC05 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttf2Q5NC05 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttf2Q5NC05 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttf2Q5NC05 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttf2Q5NC05 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttf2Q5NC05 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttf2Q5NC05 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttf2Q5NC05 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttf2Q5NC05 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttf2Q5NC05 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttf2Q5NC05 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttf2Q5NC05 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttf2Q5NC05 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttf2Q5NC05 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttf2Q5NC05 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttf2Q5NC05 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttf2Q5NC05 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttf2Q5NC05 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttf2Q5NC05 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttf2Q5NC05 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttf2Q5NC05 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttf2Q5NC05 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttf2Q5NC05 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttf2Q5NC05 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttf2Q5NC05 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttf2Q5NC05 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttf2Q5NC05 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttf2Q5NC05 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttf2Q5NC05 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttf2Q5NC05 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttf2Q5NC05 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttf2Q5NC05 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttf2Q5NC05 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttf2Q5NC05 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttf2Q5NC05 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttf2Q5NC05 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttf2Q5NC05 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ttf2Q5NC05 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttf2Q5NC05 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttf2Q5NC05 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttf2Q5NC05 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttf2Q5NC05 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttf2Q5NC05 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttf2Q5NC05 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttf2Q5NC05 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttf2Q5NC05 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttf2Q5NC05 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttf2Q5NC05 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttf2Q5NC05 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttf2Q5NC05 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttf2Q5NC05 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttf2Q5NC05 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttf2Q5NC05 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttf2Q5NC05 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttf2Q5NC05 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttf2Q5NC05 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttf2Q5NC05 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttf2Q5NC05 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttf2Q5NC05 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttf2Q5NC05 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttf2Q5NC05 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttf2Q5NC05 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttf2Q5NC05 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttf2Q5NC05 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttf2Q5NC05 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttf2Q5NC05 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttf2Q5NC05 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttf2Q5NC05 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttf2Q5NC05 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttf2Q5NC05 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttf2Q5NC05 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttf2Q5NC05 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttf2Q5NC05 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttf2Q5NC05 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttf2Q5NC05 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttf2Q5NC05 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttf2Q5NC05 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttf2Q5NC05 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttf2Q5NC05 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttf2Q5NC05 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms