Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt35Q497I4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt35Q497I4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt35Q497I4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt35Q497I4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt35Q497I4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Krt35Q497I4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Krt35Q497I4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt35Q497I4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt35Q497I4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt35Q497I4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt35Q497I4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt35Q497I4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt35Q497I4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt35Q497I4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt35Q497I4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt35Q497I4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt35Q497I4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt35Q497I4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt35Q497I4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt35Q497I4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt35Q497I4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt35Q497I4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt35Q497I4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt35Q497I4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt35Q497I4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt35Q497I4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt35Q497I4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt35Q497I4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt35Q497I4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt35Q497I4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt35Q497I4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt35Q497I4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt35Q497I4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt35Q497I4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt35Q497I4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt35Q497I4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt35Q497I4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt35Q497I4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt35Q497I4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt35Q497I4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt35Q497I4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt35Q497I4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt35Q497I4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt35Q497I4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt35Q497I4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt35Q497I4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt35Q497I4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt35Q497I4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt35Q497I4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt35Q497I4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt35Q497I4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt35Q497I4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Krt35Q497I4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt35Q497I4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt35Q497I4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt35Q497I4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt35Q497I4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt35Q497I4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt35Q497I4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt35Q497I4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt35Q497I4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt35Q497I4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt35Q497I4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt35Q497I4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt35Q497I4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt35Q497I4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt35Q497I4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt35Q497I4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt35Q497I4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt35Q497I4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt35Q497I4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt35Q497I4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt35Q497I4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt35Q497I4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt35Q497I4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt35Q497I4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt35Q497I4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt35Q497I4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt35Q497I4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt35Q497I4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt35Q497I4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt35Q497I4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt35Q497I4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt35Q497I4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt35Q497I4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt35Q497I4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt35Q497I4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt35Q497I4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt35Q497I4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt35Q497I4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt35Q497I4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt35Q497I4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt35Q497I4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt35Q497I4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt35Q497I4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt35Q497I4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt35Q497I4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt35Q497I4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt35Q497I4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.3 ms