Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pitpnm3Q3UHE1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pitpnm3Q3UHE1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pitpnm3Q3UHE1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pitpnm3Q3UHE1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pitpnm3Q3UHE1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pitpnm3Q3UHE1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pitpnm3Q3UHE1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pitpnm3Q3UHE1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pitpnm3Q3UHE1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pitpnm3Q3UHE1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pitpnm3Q3UHE1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pitpnm3Q3UHE1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pitpnm3Q3UHE1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pitpnm3Q3UHE1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pitpnm3Q3UHE1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pitpnm3Q3UHE1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pitpnm3Q3UHE1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pitpnm3Q3UHE1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pitpnm3Q3UHE1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pitpnm3Q3UHE1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pitpnm3Q3UHE1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pitpnm3Q3UHE1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pitpnm3Q3UHE1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pitpnm3Q3UHE1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pitpnm3Q3UHE1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pitpnm3Q3UHE1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pitpnm3Q3UHE1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pitpnm3Q3UHE1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pitpnm3Q3UHE1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pitpnm3Q3UHE1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pitpnm3Q3UHE1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pitpnm3Q3UHE1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pitpnm3Q3UHE1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pitpnm3Q3UHE1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pitpnm3Q3UHE1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pitpnm3Q3UHE1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pitpnm3Q3UHE1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pitpnm3Q3UHE1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pitpnm3Q3UHE1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pitpnm3Q3UHE1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pitpnm3Q3UHE1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pitpnm3Q3UHE1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pitpnm3Q3UHE1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pitpnm3Q3UHE1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pitpnm3Q3UHE1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pitpnm3Q3UHE1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pitpnm3Q3UHE1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pitpnm3Q3UHE1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pitpnm3Q3UHE1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pitpnm3Q3UHE1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms