Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q3KNL4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q3KNL4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q3KNL4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3KNL4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3KNL4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3KNL4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3KNL4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3KNL4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3KNL4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3KNL4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3KNL4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3KNL4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3KNL4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3KNL4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3KNL4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3KNL4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q3KNL4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3KNL4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3KNL4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3KNL4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3KNL4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3KNL4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3KNL4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3KNL4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3KNL4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3KNL4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3KNL4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3KNL4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3KNL4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3KNL4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3KNL4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3KNL4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3KNL4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3KNL4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3KNL4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3KNL4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q3KNL4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q3KNL4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q3KNL4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3KNL4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3KNL4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3KNL4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q3KNL4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q3KNL4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q3KNL4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q3KNL4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3KNL4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3KNL4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3KNL4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3KNL4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3KNL4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3KNL4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3KNL4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3KNL4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3KNL4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3KNL4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3KNL4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3KNL4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3KNL4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3KNL4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3KNL4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3KNL4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3KNL4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3KNL4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3KNL4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3KNL4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3KNL4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3KNL4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3KNL4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3KNL4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3KNL4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3KNL4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3KNL4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3KNL4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3KNL4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3KNL4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3KNL4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3KNL4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3KNL4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3KNL4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3KNL4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3KNL4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3KNL4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3KNL4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3KNL4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3KNL4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3KNL4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3KNL4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3KNL4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3KNL4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3KNL4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3KNL4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3KNL4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3KNL4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3KNL4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q3KNL4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q3KNL4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3KNL4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3KNL4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms