Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb8Q0VBD0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb8Q0VBD0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb8Q0VBD0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb8Q0VBD0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb8Q0VBD0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb8Q0VBD0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb8Q0VBD0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb8Q0VBD0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb8Q0VBD0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb8Q0VBD0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb8Q0VBD0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb8Q0VBD0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb8Q0VBD0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb8Q0VBD0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb8Q0VBD0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb8Q0VBD0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb8Q0VBD0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb8Q0VBD0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb8Q0VBD0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb8Q0VBD0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb8Q0VBD0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb8Q0VBD0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb8Q0VBD0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb8Q0VBD0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb8Q0VBD0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb8Q0VBD0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb8Q0VBD0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb8Q0VBD0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb8Q0VBD0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb8Q0VBD0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb8Q0VBD0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb8Q0VBD0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb8Q0VBD0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb8Q0VBD0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb8Q0VBD0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb8Q0VBD0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb8Q0VBD0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb8Q0VBD0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb8Q0VBD0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb8Q0VBD0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb8Q0VBD0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itgb8Q0VBD0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itgb8Q0VBD0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms