Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chd8Q09XV5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chd8Q09XV5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chd8Q09XV5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd8Q09XV5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd8Q09XV5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd8Q09XV5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd8Q09XV5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd8Q09XV5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd8Q09XV5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd8Q09XV5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd8Q09XV5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd8Q09XV5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd8Q09XV5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd8Q09XV5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd8Q09XV5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd8Q09XV5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd8Q09XV5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd8Q09XV5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd8Q09XV5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd8Q09XV5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd8Q09XV5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd8Q09XV5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd8Q09XV5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd8Q09XV5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd8Q09XV5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd8Q09XV5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd8Q09XV5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd8Q09XV5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd8Q09XV5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd8Q09XV5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd8Q09XV5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd8Q09XV5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd8Q09XV5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd8Q09XV5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd8Q09XV5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Chd8Q09XV5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd8Q09XV5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd8Q09XV5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd8Q09XV5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd8Q09XV5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd8Q09XV5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd8Q09XV5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd8Q09XV5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd8Q09XV5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd8Q09XV5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd8Q09XV5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd8Q09XV5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd8Q09XV5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd8Q09XV5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd8Q09XV5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd8Q09XV5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd8Q09XV5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd8Q09XV5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd8Q09XV5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd8Q09XV5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd8Q09XV5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd8Q09XV5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd8Q09XV5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd8Q09XV5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd8Q09XV5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd8Q09XV5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd8Q09XV5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd8Q09XV5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd8Q09XV5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd8Q09XV5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd8Q09XV5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd8Q09XV5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd8Q09XV5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd8Q09XV5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd8Q09XV5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd8Q09XV5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd8Q09XV5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd8Q09XV5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd8Q09XV5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd8Q09XV5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd8Q09XV5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd8Q09XV5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd8Q09XV5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd8Q09XV5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd8Q09XV5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd8Q09XV5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd8Q09XV5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd8Q09XV5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd8Q09XV5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd8Q09XV5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd8Q09XV5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd8Q09XV5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd8Q09XV5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd8Q09XV5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd8Q09XV5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd8Q09XV5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd8Q09XV5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd8Q09XV5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd8Q09XV5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd8Q09XV5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd8Q09XV5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd8Q09XV5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd8Q09XV5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd8Q09XV5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms