Protein–RNA interactions for Protein: Q05BQ1

Igsf9, Protein turtle homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf9Q05BQ1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Igsf9Q05BQ1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Igsf9Q05BQ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Igsf9Q05BQ1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Igsf9Q05BQ1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Igsf9Q05BQ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Igsf9Q05BQ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Igsf9Q05BQ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Igsf9Q05BQ1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Igsf9Q05BQ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Igsf9Q05BQ1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Igsf9Q05BQ1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Igsf9Q05BQ1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Igsf9Q05BQ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Igsf9Q05BQ1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Igsf9Q05BQ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Igsf9Q05BQ1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Igsf9Q05BQ1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Igsf9Q05BQ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Igsf9Q05BQ1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Igsf9Q05BQ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Igsf9Q05BQ1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Igsf9Q05BQ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Igsf9Q05BQ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Igsf9Q05BQ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Igsf9Q05BQ1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Igsf9Q05BQ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Igsf9Q05BQ1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Igsf9Q05BQ1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Igsf9Q05BQ1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Igsf9Q05BQ1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Igsf9Q05BQ1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Igsf9Q05BQ1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Igsf9Q05BQ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Igsf9Q05BQ1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Igsf9Q05BQ1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Igsf9Q05BQ1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Igsf9Q05BQ1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Igsf9Q05BQ1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Igsf9Q05BQ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Igsf9Q05BQ1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Igsf9Q05BQ1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Igsf9Q05BQ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Igsf9Q05BQ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Igsf9Q05BQ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Igsf9Q05BQ1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Igsf9Q05BQ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Igsf9Q05BQ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Igsf9Q05BQ1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Igsf9Q05BQ1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Igsf9Q05BQ1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Igsf9Q05BQ1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Igsf9Q05BQ1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Igsf9Q05BQ1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Igsf9Q05BQ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Igsf9Q05BQ1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Igsf9Q05BQ1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Igsf9Q05BQ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Igsf9Q05BQ1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Igsf9Q05BQ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Igsf9Q05BQ1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Igsf9Q05BQ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Igsf9Q05BQ1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Igsf9Q05BQ1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Igsf9Q05BQ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Igsf9Q05BQ1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Igsf9Q05BQ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Igsf9Q05BQ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Igsf9Q05BQ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Igsf9Q05BQ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Igsf9Q05BQ1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Igsf9Q05BQ1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Igsf9Q05BQ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Igsf9Q05BQ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Igsf9Q05BQ1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Igsf9Q05BQ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Igsf9Q05BQ1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Igsf9Q05BQ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Igsf9Q05BQ1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Igsf9Q05BQ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Igsf9Q05BQ1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Igsf9Q05BQ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Igsf9Q05BQ1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Igsf9Q05BQ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Igsf9Q05BQ1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Igsf9Q05BQ1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Igsf9Q05BQ1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Igsf9Q05BQ1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Igsf9Q05BQ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Igsf9Q05BQ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Igsf9Q05BQ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Igsf9Q05BQ1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Igsf9Q05BQ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Igsf9Q05BQ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Igsf9Q05BQ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Igsf9Q05BQ1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Igsf9Q05BQ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Igsf9Q05BQ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Igsf9Q05BQ1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Igsf9Q05BQ1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms