Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdk16Q04735 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk16Q04735 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk16Q04735 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk16Q04735 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk16Q04735 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk16Q04735 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk16Q04735 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk16Q04735 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk16Q04735 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk16Q04735 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk16Q04735 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk16Q04735 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk16Q04735 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk16Q04735 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk16Q04735 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk16Q04735 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk16Q04735 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk16Q04735 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk16Q04735 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk16Q04735 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk16Q04735 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk16Q04735 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk16Q04735 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk16Q04735 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk16Q04735 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk16Q04735 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk16Q04735 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk16Q04735 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk16Q04735 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk16Q04735 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk16Q04735 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk16Q04735 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdk16Q04735 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk16Q04735 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk16Q04735 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk16Q04735 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk16Q04735 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk16Q04735 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk16Q04735 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk16Q04735 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk16Q04735 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk16Q04735 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk16Q04735 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk16Q04735 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk16Q04735 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk16Q04735 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk16Q04735 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk16Q04735 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk16Q04735 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk16Q04735 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdk16Q04735 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk16Q04735 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk16Q04735 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk16Q04735 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk16Q04735 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk16Q04735 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk16Q04735 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk16Q04735 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk16Q04735 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk16Q04735 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk16Q04735 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk16Q04735 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk16Q04735 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk16Q04735 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk16Q04735 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk16Q04735 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk16Q04735 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk16Q04735 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk16Q04735 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk16Q04735 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk16Q04735 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk16Q04735 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk16Q04735 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk16Q04735 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk16Q04735 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk16Q04735 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk16Q04735 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk16Q04735 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk16Q04735 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk16Q04735 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk16Q04735 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk16Q04735 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk16Q04735 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk16Q04735 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk16Q04735 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk16Q04735 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk16Q04735 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk16Q04735 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk16Q04735 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk16Q04735 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk16Q04735 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk16Q04735 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk16Q04735 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk16Q04735 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk16Q04735 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk16Q04735 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk16Q04735 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk16Q04735 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk16Q04735 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms