Protein–RNA interactions for Protein: Q02526

Zfp41, Zinc finger protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp41Q02526 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp41Q02526 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp41Q02526 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp41Q02526 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp41Q02526 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp41Q02526 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp41Q02526 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp41Q02526 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp41Q02526 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp41Q02526 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp41Q02526 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp41Q02526 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp41Q02526 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp41Q02526 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp41Q02526 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp41Q02526 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp41Q02526 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp41Q02526 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp41Q02526 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp41Q02526 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp41Q02526 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp41Q02526 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp41Q02526 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp41Q02526 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp41Q02526 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp41Q02526 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp41Q02526 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp41Q02526 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp41Q02526 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp41Q02526 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp41Q02526 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp41Q02526 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp41Q02526 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp41Q02526 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp41Q02526 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp41Q02526 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp41Q02526 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp41Q02526 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp41Q02526 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp41Q02526 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp41Q02526 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp41Q02526 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp41Q02526 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp41Q02526 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp41Q02526 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp41Q02526 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp41Q02526 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp41Q02526 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp41Q02526 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp41Q02526 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp41Q02526 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp41Q02526 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp41Q02526 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp41Q02526 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zfp41Q02526 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp41Q02526 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp41Q02526 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp41Q02526 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp41Q02526 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp41Q02526 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp41Q02526 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp41Q02526 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp41Q02526 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp41Q02526 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp41Q02526 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp41Q02526 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Zfp41Q02526 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp41Q02526 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp41Q02526 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp41Q02526 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp41Q02526 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp41Q02526 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp41Q02526 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp41Q02526 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp41Q02526 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp41Q02526 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp41Q02526 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp41Q02526 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp41Q02526 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp41Q02526 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp41Q02526 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp41Q02526 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp41Q02526 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp41Q02526 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp41Q02526 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp41Q02526 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp41Q02526 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp41Q02526 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp41Q02526 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp41Q02526 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp41Q02526 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp41Q02526 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp41Q02526 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp41Q02526 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp41Q02526 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp41Q02526 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfp41Q02526 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfp41Q02526 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfp41Q02526 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp41Q02526 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms