Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna1cQ01815 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1cQ01815 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1cQ01815 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna1cQ01815 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna1cQ01815 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1cQ01815 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1cQ01815 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1cQ01815 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1cQ01815 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1cQ01815 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1cQ01815 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1cQ01815 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1cQ01815 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1cQ01815 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1cQ01815 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1cQ01815 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1cQ01815 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1cQ01815 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1cQ01815 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1cQ01815 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1cQ01815 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacna1cQ01815 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1cQ01815 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1cQ01815 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1cQ01815 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1cQ01815 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1cQ01815 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1cQ01815 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1cQ01815 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1cQ01815 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1cQ01815 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1cQ01815 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1cQ01815 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1cQ01815 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacna1cQ01815 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacna1cQ01815 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna1cQ01815 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1cQ01815 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1cQ01815 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1cQ01815 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1cQ01815 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna1cQ01815 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna1cQ01815 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna1cQ01815 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna1cQ01815 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna1cQ01815 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna1cQ01815 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna1cQ01815 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna1cQ01815 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna1cQ01815 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna1cQ01815 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna1cQ01815 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna1cQ01815 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1cQ01815 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1cQ01815 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna1cQ01815 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna1cQ01815 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna1cQ01815 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna1cQ01815 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna1cQ01815 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1cQ01815 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1cQ01815 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna1cQ01815 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna1cQ01815 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna1cQ01815 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna1cQ01815 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna1cQ01815 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna1cQ01815 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna1cQ01815 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna1cQ01815 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1cQ01815 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1cQ01815 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna1cQ01815 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacna1cQ01815 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1cQ01815 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1cQ01815 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1cQ01815 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1cQ01815 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna1cQ01815 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna1cQ01815 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1cQ01815 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1cQ01815 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1cQ01815 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1cQ01815 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1cQ01815 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1cQ01815 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1cQ01815 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna1cQ01815 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cacna1cQ01815 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1cQ01815 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1cQ01815 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1cQ01815 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1cQ01815 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1cQ01815 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1cQ01815 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1cQ01815 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1cQ01815 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1cQ01815 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1cQ01815 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms