Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thumpd3P97770 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thumpd3P97770 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Thumpd3P97770 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Thumpd3P97770 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Thumpd3P97770 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thumpd3P97770 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thumpd3P97770 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thumpd3P97770 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thumpd3P97770 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Thumpd3P97770 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thumpd3P97770 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Thumpd3P97770 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Thumpd3P97770 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Thumpd3P97770 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thumpd3P97770 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thumpd3P97770 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Thumpd3P97770 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thumpd3P97770 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Thumpd3P97770 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Thumpd3P97770 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Thumpd3P97770 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thumpd3P97770 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thumpd3P97770 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thumpd3P97770 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thumpd3P97770 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thumpd3P97770 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thumpd3P97770 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thumpd3P97770 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thumpd3P97770 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thumpd3P97770 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Thumpd3P97770 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Thumpd3P97770 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Thumpd3P97770 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Thumpd3P97770 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Thumpd3P97770 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Thumpd3P97770 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thumpd3P97770 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thumpd3P97770 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Thumpd3P97770 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Thumpd3P97770 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Thumpd3P97770 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Thumpd3P97770 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Thumpd3P97770 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Thumpd3P97770 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Thumpd3P97770 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Thumpd3P97770 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Thumpd3P97770 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Thumpd3P97770 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Thumpd3P97770 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thumpd3P97770 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thumpd3P97770 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thumpd3P97770 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Thumpd3P97770 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Thumpd3P97770 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Thumpd3P97770 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Thumpd3P97770 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Thumpd3P97770 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Thumpd3P97770 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Thumpd3P97770 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Thumpd3P97770 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Thumpd3P97770 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Thumpd3P97770 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Thumpd3P97770 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Thumpd3P97770 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Thumpd3P97770 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Thumpd3P97770 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Thumpd3P97770 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Thumpd3P97770 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Thumpd3P97770 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Thumpd3P97770 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Thumpd3P97770 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Thumpd3P97770 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Thumpd3P97770 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Thumpd3P97770 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Thumpd3P97770 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Thumpd3P97770 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Thumpd3P97770 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms