Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptprn2P80560 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptprn2P80560 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptprn2P80560 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptprn2P80560 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptprn2P80560 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptprn2P80560 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptprn2P80560 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ptprn2P80560 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptprn2P80560 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptprn2P80560 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptprn2P80560 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptprn2P80560 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptprn2P80560 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptprn2P80560 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptprn2P80560 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptprn2P80560 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptprn2P80560 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptprn2P80560 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptprn2P80560 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptprn2P80560 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptprn2P80560 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptprn2P80560 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptprn2P80560 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptprn2P80560 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptprn2P80560 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptprn2P80560 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptprn2P80560 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptprn2P80560 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptprn2P80560 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptprn2P80560 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ptprn2P80560 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ptprn2P80560 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptprn2P80560 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptprn2P80560 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptprn2P80560 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptprn2P80560 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptprn2P80560 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptprn2P80560 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptprn2P80560 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptprn2P80560 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptprn2P80560 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptprn2P80560 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptprn2P80560 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ptprn2P80560 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptprn2P80560 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptprn2P80560 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptprn2P80560 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptprn2P80560 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptprn2P80560 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptprn2P80560 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptprn2P80560 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptprn2P80560 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptprn2P80560 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptprn2P80560 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptprn2P80560 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptprn2P80560 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptprn2P80560 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptprn2P80560 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptprn2P80560 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptprn2P80560 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptprn2P80560 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptprn2P80560 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptprn2P80560 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptprn2P80560 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptprn2P80560 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptprn2P80560 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptprn2P80560 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptprn2P80560 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptprn2P80560 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptprn2P80560 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptprn2P80560 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptprn2P80560 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptprn2P80560 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ptprn2P80560 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ptprn2P80560 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ptprn2P80560 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ptprn2P80560 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptprn2P80560 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptprn2P80560 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptprn2P80560 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptprn2P80560 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptprn2P80560 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptprn2P80560 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptprn2P80560 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptprn2P80560 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptprn2P80560 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptprn2P80560 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptprn2P80560 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptprn2P80560 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptprn2P80560 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptprn2P80560 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptprn2P80560 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptprn2P80560 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ptprn2P80560 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ptprn2P80560 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ptprn2P80560 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptprn2P80560 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptprn2P80560 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptprn2P80560 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms