Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx1bP61264 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx1bP61264 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx1bP61264 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx1bP61264 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx1bP61264 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx1bP61264 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx1bP61264 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx1bP61264 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx1bP61264 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx1bP61264 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx1bP61264 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx1bP61264 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx1bP61264 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx1bP61264 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx1bP61264 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx1bP61264 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx1bP61264 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx1bP61264 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx1bP61264 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx1bP61264 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx1bP61264 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx1bP61264 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx1bP61264 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx1bP61264 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Stx1bP61264 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx1bP61264 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx1bP61264 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx1bP61264 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx1bP61264 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx1bP61264 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx1bP61264 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx1bP61264 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx1bP61264 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx1bP61264 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx1bP61264 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx1bP61264 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx1bP61264 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx1bP61264 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx1bP61264 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx1bP61264 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx1bP61264 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx1bP61264 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx1bP61264 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx1bP61264 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Stx1bP61264 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx1bP61264 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms