Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Paxbp1P58501 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Paxbp1P58501 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Paxbp1P58501 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Paxbp1P58501 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Paxbp1P58501 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Paxbp1P58501 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Paxbp1P58501 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Paxbp1P58501 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Paxbp1P58501 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Paxbp1P58501 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Paxbp1P58501 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Paxbp1P58501 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Paxbp1P58501 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Paxbp1P58501 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Paxbp1P58501 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Paxbp1P58501 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Paxbp1P58501 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Paxbp1P58501 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Paxbp1P58501 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Paxbp1P58501 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Paxbp1P58501 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Paxbp1P58501 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Paxbp1P58501 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Paxbp1P58501 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Paxbp1P58501 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Paxbp1P58501 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Paxbp1P58501 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Paxbp1P58501 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Paxbp1P58501 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Paxbp1P58501 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Paxbp1P58501 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Paxbp1P58501 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Paxbp1P58501 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Paxbp1P58501 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Paxbp1P58501 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Paxbp1P58501 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Paxbp1P58501 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Paxbp1P58501 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Paxbp1P58501 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Paxbp1P58501 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Paxbp1P58501 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Paxbp1P58501 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Paxbp1P58501 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Paxbp1P58501 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Paxbp1P58501 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Paxbp1P58501 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Paxbp1P58501 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Paxbp1P58501 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Paxbp1P58501 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Paxbp1P58501 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Paxbp1P58501 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Paxbp1P58501 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Paxbp1P58501 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Paxbp1P58501 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Paxbp1P58501 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Paxbp1P58501 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Paxbp1P58501 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Paxbp1P58501 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Paxbp1P58501 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Paxbp1P58501 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Paxbp1P58501 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Paxbp1P58501 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Paxbp1P58501 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Paxbp1P58501 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Paxbp1P58501 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Paxbp1P58501 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Paxbp1P58501 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Paxbp1P58501 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Paxbp1P58501 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Paxbp1P58501 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Paxbp1P58501 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Paxbp1P58501 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Paxbp1P58501 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Paxbp1P58501 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Paxbp1P58501 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Paxbp1P58501 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms