Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctbp2P56546 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctbp2P56546 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctbp2P56546 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctbp2P56546 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctbp2P56546 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctbp2P56546 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctbp2P56546 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctbp2P56546 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctbp2P56546 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctbp2P56546 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctbp2P56546 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctbp2P56546 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctbp2P56546 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctbp2P56546 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctbp2P56546 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctbp2P56546 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctbp2P56546 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctbp2P56546 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctbp2P56546 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctbp2P56546 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctbp2P56546 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctbp2P56546 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctbp2P56546 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctbp2P56546 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctbp2P56546 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctbp2P56546 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctbp2P56546 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctbp2P56546 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctbp2P56546 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctbp2P56546 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctbp2P56546 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctbp2P56546 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctbp2P56546 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctbp2P56546 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctbp2P56546 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctbp2P56546 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctbp2P56546 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctbp2P56546 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctbp2P56546 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ctbp2P56546 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctbp2P56546 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctbp2P56546 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctbp2P56546 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctbp2P56546 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctbp2P56546 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctbp2P56546 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctbp2P56546 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctbp2P56546 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctbp2P56546 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctbp2P56546 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctbp2P56546 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctbp2P56546 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctbp2P56546 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctbp2P56546 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctbp2P56546 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctbp2P56546 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctbp2P56546 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctbp2P56546 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctbp2P56546 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctbp2P56546 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctbp2P56546 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctbp2P56546 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctbp2P56546 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctbp2P56546 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctbp2P56546 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctbp2P56546 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctbp2P56546 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctbp2P56546 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctbp2P56546 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctbp2P56546 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctbp2P56546 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms