Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pms2P54279 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pms2P54279 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pms2P54279 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pms2P54279 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pms2P54279 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pms2P54279 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pms2P54279 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pms2P54279 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pms2P54279 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pms2P54279 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pms2P54279 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pms2P54279 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pms2P54279 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pms2P54279 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pms2P54279 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pms2P54279 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pms2P54279 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pms2P54279 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pms2P54279 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pms2P54279 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pms2P54279 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pms2P54279 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pms2P54279 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pms2P54279 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pms2P54279 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pms2P54279 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pms2P54279 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pms2P54279 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pms2P54279 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pms2P54279 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pms2P54279 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pms2P54279 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pms2P54279 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pms2P54279 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pms2P54279 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pms2P54279 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pms2P54279 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pms2P54279 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pms2P54279 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pms2P54279 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pms2P54279 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pms2P54279 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pms2P54279 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pms2P54279 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pms2P54279 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pms2P54279 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pms2P54279 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pms2P54279 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pms2P54279 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pms2P54279 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pms2P54279 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pms2P54279 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pms2P54279 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pms2P54279 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pms2P54279 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pms2P54279 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Pms2P54279 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pms2P54279 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pms2P54279 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pms2P54279 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pms2P54279 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pms2P54279 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pms2P54279 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pms2P54279 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pms2P54279 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pms2P54279 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pms2P54279 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pms2P54279 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pms2P54279 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pms2P54279 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pms2P54279 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pms2P54279 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pms2P54279 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pms2P54279 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pms2P54279 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pms2P54279 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pms2P54279 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pms2P54279 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pms2P54279 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pms2P54279 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pms2P54279 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pms2P54279 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pms2P54279 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pms2P54279 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pms2P54279 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pms2P54279 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pms2P54279 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pms2P54279 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pms2P54279 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pms2P54279 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pms2P54279 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pms2P54279 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pms2P54279 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pms2P54279 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pms2P54279 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pms2P54279 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pms2P54279 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pms2P54279 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pms2P54279 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms