Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syt4P40749 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syt4P40749 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syt4P40749 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syt4P40749 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syt4P40749 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syt4P40749 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syt4P40749 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syt4P40749 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syt4P40749 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syt4P40749 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt4P40749 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt4P40749 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syt4P40749 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syt4P40749 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syt4P40749 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syt4P40749 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syt4P40749 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syt4P40749 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syt4P40749 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syt4P40749 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syt4P40749 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syt4P40749 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syt4P40749 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syt4P40749 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syt4P40749 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syt4P40749 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syt4P40749 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syt4P40749 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syt4P40749 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syt4P40749 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syt4P40749 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syt4P40749 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syt4P40749 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syt4P40749 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syt4P40749 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syt4P40749 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syt4P40749 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syt4P40749 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syt4P40749 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syt4P40749 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syt4P40749 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syt4P40749 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syt4P40749 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syt4P40749 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syt4P40749 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syt4P40749 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syt4P40749 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syt4P40749 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt4P40749 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt4P40749 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt4P40749 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt4P40749 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syt4P40749 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syt4P40749 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syt4P40749 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Syt4P40749 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syt4P40749 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Syt4P40749 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syt4P40749 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syt4P40749 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syt4P40749 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syt4P40749 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syt4P40749 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syt4P40749 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syt4P40749 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syt4P40749 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syt4P40749 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syt4P40749 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Syt4P40749 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syt4P40749 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syt4P40749 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syt4P40749 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syt4P40749 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syt4P40749 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Syt4P40749 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syt4P40749 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syt4P40749 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syt4P40749 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syt4P40749 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syt4P40749 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syt4P40749 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt4P40749 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt4P40749 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt4P40749 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt4P40749 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt4P40749 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syt4P40749 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt4P40749 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt4P40749 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt4P40749 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt4P40749 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt4P40749 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syt4P40749 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syt4P40749 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syt4P40749 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syt4P40749 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syt4P40749 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt4P40749 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Syt4P40749 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms