Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fen1P39749 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fen1P39749 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Fen1P39749 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fen1P39749 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fen1P39749 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fen1P39749 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fen1P39749 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fen1P39749 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fen1P39749 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fen1P39749 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fen1P39749 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Fen1P39749 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fen1P39749 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fen1P39749 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fen1P39749 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fen1P39749 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fen1P39749 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fen1P39749 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fen1P39749 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fen1P39749 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fen1P39749 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fen1P39749 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fen1P39749 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fen1P39749 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fen1P39749 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fen1P39749 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Fen1P39749 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fen1P39749 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fen1P39749 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fen1P39749 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fen1P39749 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fen1P39749 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fen1P39749 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fen1P39749 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fen1P39749 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fen1P39749 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fen1P39749 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fen1P39749 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fen1P39749 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fen1P39749 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fen1P39749 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fen1P39749 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fen1P39749 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fen1P39749 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fen1P39749 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fen1P39749 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fen1P39749 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fen1P39749 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fen1P39749 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fen1P39749 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fen1P39749 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fen1P39749 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fen1P39749 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fen1P39749 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fen1P39749 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fen1P39749 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fen1P39749 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fen1P39749 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fen1P39749 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fen1P39749 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fen1P39749 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fen1P39749 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fen1P39749 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fen1P39749 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fen1P39749 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fen1P39749 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fen1P39749 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fen1P39749 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fen1P39749 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fen1P39749 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fen1P39749 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fen1P39749 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fen1P39749 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fen1P39749 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fen1P39749 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fen1P39749 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fen1P39749 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fen1P39749 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Fen1P39749 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fen1P39749 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fen1P39749 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fen1P39749 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fen1P39749 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fen1P39749 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fen1P39749 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fen1P39749 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fen1P39749 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fen1P39749 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fen1P39749 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fen1P39749 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fen1P39749 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fen1P39749 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fen1P39749 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fen1P39749 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fen1P39749 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fen1P39749 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fen1P39749 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fen1P39749 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fen1P39749 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms