Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ddit3P35639 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ddit3P35639 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ddit3P35639 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ddit3P35639 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ddit3P35639 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ddit3P35639 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ddit3P35639 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Ddit3P35639 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ddit3P35639 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ddit3P35639 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ddit3P35639 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ddit3P35639 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ddit3P35639 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ddit3P35639 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ddit3P35639 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ddit3P35639 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ddit3P35639 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ddit3P35639 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ddit3P35639 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ddit3P35639 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ddit3P35639 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ddit3P35639 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ddit3P35639 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Ddit3P35639 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ddit3P35639 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ddit3P35639 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ddit3P35639 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ddit3P35639 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ddit3P35639 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ddit3P35639 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ddit3P35639 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ddit3P35639 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ddit3P35639 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ddit3P35639 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ddit3P35639 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ddit3P35639 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ddit3P35639 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ddit3P35639 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ddit3P35639 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ddit3P35639 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ddit3P35639 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ddit3P35639 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ddit3P35639 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ddit3P35639 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ddit3P35639 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ddit3P35639 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ddit3P35639 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Ddit3P35639 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ddit3P35639 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ddit3P35639 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ddit3P35639 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ddit3P35639 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ddit3P35639 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ddit3P35639 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ddit3P35639 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ddit3P35639 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ddit3P35639 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ddit3P35639 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ddit3P35639 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Ddit3P35639 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ddit3P35639 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ddit3P35639 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ddit3P35639 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ddit3P35639 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ddit3P35639 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ddit3P35639 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ddit3P35639 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ddit3P35639 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ddit3P35639 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ddit3P35639 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ddit3P35639 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ddit3P35639 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ddit3P35639 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ddit3P35639 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ddit3P35639 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ddit3P35639 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ddit3P35639 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ddit3P35639 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ddit3P35639 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ddit3P35639 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ddit3P35639 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ddit3P35639 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ddit3P35639 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ddit3P35639 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ddit3P35639 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ddit3P35639 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ddit3P35639 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ddit3P35639 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ddit3P35639 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ddit3P35639 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ddit3P35639 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ddit3P35639 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ddit3P35639 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ddit3P35639 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ddit3P35639 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ddit3P35639 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ddit3P35639 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ddit3P35639 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ddit3P35639 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms