Protein–RNA interactions for Protein: P33534

Oprk1, Kappa-type opioid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oprk1P33534 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Oprk1P33534 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Oprk1P33534 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Oprk1P33534 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Oprk1P33534 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Oprk1P33534 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Oprk1P33534 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Oprk1P33534 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Oprk1P33534 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Oprk1P33534 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Oprk1P33534 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Oprk1P33534 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Oprk1P33534 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Oprk1P33534 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Oprk1P33534 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Oprk1P33534 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Oprk1P33534 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Oprk1P33534 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Oprk1P33534 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Oprk1P33534 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Oprk1P33534 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Oprk1P33534 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Oprk1P33534 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Oprk1P33534 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Oprk1P33534 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Oprk1P33534 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Oprk1P33534 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Oprk1P33534 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Oprk1P33534 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Oprk1P33534 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Oprk1P33534 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Oprk1P33534 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Oprk1P33534 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Oprk1P33534 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Oprk1P33534 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Oprk1P33534 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Oprk1P33534 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Oprk1P33534 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Oprk1P33534 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Oprk1P33534 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Oprk1P33534 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Oprk1P33534 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Oprk1P33534 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Oprk1P33534 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Oprk1P33534 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Oprk1P33534 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Oprk1P33534 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Oprk1P33534 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Oprk1P33534 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Oprk1P33534 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Oprk1P33534 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Oprk1P33534 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Oprk1P33534 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Oprk1P33534 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Oprk1P33534 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Oprk1P33534 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Oprk1P33534 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Oprk1P33534 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Oprk1P33534 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Oprk1P33534 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Oprk1P33534 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Oprk1P33534 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Oprk1P33534 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Oprk1P33534 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Oprk1P33534 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Oprk1P33534 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Oprk1P33534 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Oprk1P33534 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Oprk1P33534 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Oprk1P33534 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Oprk1P33534 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Oprk1P33534 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Oprk1P33534 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Oprk1P33534 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Oprk1P33534 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms