Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc5P32043 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc5P32043 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc5P32043 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc5P32043 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc5P32043 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc5P32043 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc5P32043 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc5P32043 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc5P32043 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc5P32043 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc5P32043 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc5P32043 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc5P32043 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc5P32043 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc5P32043 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxc5P32043 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc5P32043 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc5P32043 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc5P32043 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc5P32043 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc5P32043 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc5P32043 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc5P32043 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc5P32043 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc5P32043 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc5P32043 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc5P32043 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc5P32043 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc5P32043 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc5P32043 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc5P32043 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc5P32043 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc5P32043 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc5P32043 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc5P32043 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc5P32043 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc5P32043 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc5P32043 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc5P32043 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc5P32043 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc5P32043 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc5P32043 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc5P32043 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc5P32043 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc5P32043 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc5P32043 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc5P32043 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc5P32043 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc5P32043 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc5P32043 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc5P32043 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc5P32043 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc5P32043 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc5P32043 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc5P32043 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc5P32043 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc5P32043 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc5P32043 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxc5P32043 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc5P32043 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc5P32043 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc5P32043 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc5P32043 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc5P32043 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc5P32043 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc5P32043 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc5P32043 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc5P32043 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc5P32043 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc5P32043 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc5P32043 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc5P32043 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc5P32043 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc5P32043 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc5P32043 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc5P32043 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc5P32043 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms