Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa2P28309 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa2P28309 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa2P28309 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa2P28309 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa2P28309 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa2P28309 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa2P28309 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa2P28309 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa2P28309 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Defa2P28309 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Defa2P28309 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa2P28309 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa2P28309 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa2P28309 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa2P28309 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa2P28309 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa2P28309 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa2P28309 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa2P28309 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa2P28309 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa2P28309 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa2P28309 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa2P28309 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa2P28309 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa2P28309 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa2P28309 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa2P28309 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa2P28309 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa2P28309 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa2P28309 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa2P28309 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa2P28309 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Defa2P28309 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Defa2P28309 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa2P28309 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa2P28309 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms