Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd48P18181 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd48P18181 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd48P18181 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd48P18181 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd48P18181 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd48P18181 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd48P18181 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd48P18181 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd48P18181 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd48P18181 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd48P18181 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd48P18181 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd48P18181 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd48P18181 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd48P18181 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd48P18181 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd48P18181 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd48P18181 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd48P18181 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd48P18181 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd48P18181 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd48P18181 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd48P18181 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd48P18181 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd48P18181 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd48P18181 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd48P18181 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd48P18181 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd48P18181 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd48P18181 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd48P18181 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd48P18181 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd48P18181 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd48P18181 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd48P18181 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd48P18181 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd48P18181 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd48P18181 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd48P18181 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd48P18181 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd48P18181 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd48P18181 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd48P18181 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd48P18181 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd48P18181 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd48P18181 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd48P18181 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd48P18181 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd48P18181 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd48P18181 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd48P18181 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd48P18181 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd48P18181 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd48P18181 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd48P18181 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd48P18181 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd48P18181 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd48P18181 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd48P18181 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd48P18181 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd48P18181 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd48P18181 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd48P18181 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd48P18181 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd48P18181 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd48P18181 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd48P18181 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd48P18181 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd48P18181 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd48P18181 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd48P18181 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd48P18181 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd48P18181 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd48P18181 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd48P18181 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd48P18181 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd48P18181 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd48P18181 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd48P18181 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd48P18181 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd48P18181 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd48P18181 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd48P18181 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd48P18181 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd48P18181 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd48P18181 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd48P18181 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd48P18181 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd48P18181 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd48P18181 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd48P18181 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd48P18181 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd48P18181 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cd48P18181 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd48P18181 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd48P18181 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd48P18181 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd48P18181 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd48P18181 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms