Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tnp1P10856 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tnp1P10856 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms